RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa26.14■■□□□ 1.78
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PI3P19957 117 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 F2RP25116 425 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX45Q8NA69 505 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPSG1Q9NRR2 321 aa26.14■■□□□ 1.78
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SHISA2Q6UWI4 295 aa26.13■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 AIFM2Q9BRQ8 373 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51J1Q9H342 316 aa26.13■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CLCC1Q96S66 551 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00527Q9UJ94 153 aa26.1■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NQO2P16083 231 aa26.09■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF585BQ52M93 769 aa26.08■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2A4O95047 310 aa26.07■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSX9Q7RTT3 188 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KBTBD11O94819 623 aa26.05■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF846Q147U1 533 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPXA8MT69 81 aa26.04■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GNB1P62873 340 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4A47Q6IF82 309 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf44Q8N8P7 122 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4X2Q8NGF9 303 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD5Q8WTS1 349 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 R3HDM4Q96D70 268 aa26.04■■□□□ 1.76
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