RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC58Q4VC31 144 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR10K2Q6IF99 312 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 AMIGO2Q86SJ2 522 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 CDH26Q8IXH8 852 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q8NAQ8 132 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 C5orf30Q96GV9 206 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 AMBNQ9NP70 447 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 RDH8Q9NYR8 311 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 CKLFQ9UBR5 152 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 POMPQ9Y244 141 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR4C46A6NHA9 309 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 TEX22C9J3V5 150 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 E7EUB6 86 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 OGG1O15527 345 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 ACTL6BO94805 426 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 CLEC3BP05452 202 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 GABRB1P18505 474 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 HTR2CP28335 458 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 CBX3Q13185 183 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 RTL8BQ17RB0 113 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR52I1Q8NGK6 324 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 CRYZL1O95825 349 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 LALBAP00709 142 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 AMBPP02760 352 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 MYOD1P15172 320 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 PSMB6P28072 239 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM187Q14656 261 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q499Y3 187 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 MMD2Q8IY49 270 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMIM19Q96E16 107 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 NICN1Q9BSH3 213 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR2D2Q9H210 308 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q9N2K0 584 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 AK3Q9UIJ7 227 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A1B0GW64 132 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 CRYGCP07315 174 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 RRASP10301 218 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPR183P32249 361 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 CDK10Q15131 360 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 KLK9Q2XQG4 91 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q6ZRM9 215 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 GHRLQ9UBU3 117 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A0A6YYD4 124 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 DPPA5A6NC42 116 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINC00473A8K010 186 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 ATP5HO75947 161 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 CD3GP09693 182 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 GSTT2P0CG29 244 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 GSTT2BP0CG30 244 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 AREGP15514 252 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPA2P15927 270 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 ETV1P50549 477 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 TPBGQ13641 420 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 PLET1Q6UQ28 207 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 TM2D1Q9BX74 207 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDNEP1-202ENST00000570380 KCNK15Q9H427 330 aa7.54□□□□□ -1.2
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