RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C15orf62A8K5M9 175 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PAGE4O60829 102 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MBP02144 154 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAT1Q6PIZ9 186 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SNX22Q96L94 193 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR6C3Q9NZP0 311 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV3A0A0B4J244 114 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC31A2O15432 143 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HOXA5P20719 270 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERVK-16P61578 105 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NAT8Q9UHE5 227 aa10.29□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1B0GWJ7 208 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C17orf112F2Z3M2 114 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HPRT1P00492 218 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CD1BP29016 333 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GFI1BQ5VTD9 330 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q8TCH9 128 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SDSLQ96GA7 329 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 S1PR3Q99500 378 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MIOXQ9UGB7 285 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 JPT1Q9UK76 154 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RNF224P0DH78 156 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BPIFB3P59826 476 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBE2G2P60604 165 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RTP5Q14D33 572 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PARLQ9H300 379 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CALYQ9NYX4 217 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HCFC1P51610 2035 aa10.27□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRGC1P0CF51 173 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 S100A2P29034 98 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GNB2P62879 340 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BSXQ3C1V8 233 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C16orf82Q7Z2V1 217 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABHD12Q8N2K0 398 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FRZBQ92765 325 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM215AQ9Y5M1 114 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IFITM10A6NMD0 228 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RRHO14718 337 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KBTBD11O94819 623 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RD3LP0DJH9 198 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LOXL3P58215 753 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TIMM23BQ5SRD1 257 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM68Q96MH6 324 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IFI27L2Q9H2X8 130 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PCNX1Q96RV3 2341 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 YPEL1O60688 119 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OPN1MWP04001 364 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OPN1MW2P0DN77 364 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OPN1MW3P0DN78 364 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM27E3Q08E93 113 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CST9LP1Q5W188 147 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 YPEL2Q96QA6 119 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM140Q9NV12 185 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1W2PPV4 95 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPP1R2P9O14990 202 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GLRXP35754 106 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RND2P52198 227 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPCS3P61009 180 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPL23P62829 140 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM90A1Q86YD7 464 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C1orf174Q8IYL3 243 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABHD5Q8WTS1 349 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GGACTQ9BVM4 153 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HINT2Q9BX68 163 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GPR61Q9BZJ8 451 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MANBALQ9NQG1 85 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM242Q9NWH2 141 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAB2Q9UQC2 676 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ACACAQ13085 2346 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C11orf94C9JXX5 98 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 K7EM74 188 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GNG10P50151 68 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VWC2Q2TAL6 325 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR51G1Q8NGK1 321 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM250H0YL14 139 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-204ENST00000567780 H7BYZ3 331 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms