RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPL30P62888 115 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MMD2Q8IY49 270 aa13.24□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHOVQ96L33 236 aa13.24□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 AIFM2Q9BRQ8 373 aa13.24□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMIM18P0DKX4 95 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRSS3P35030 304 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 RORCP51449 518 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAS2R46P59540 309 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNXAQ16473 311 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASPHD1Q5U4P2 390 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MFSD4AQ8N468 514 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASTOR1Q8WTX7 329 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SECTM1Q8WVN6 248 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MS4A10Q96PG2 267 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHB2Q99623 299 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPIN2AQ99865 258 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAS2R8Q9NYW2 309 aa13.23□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP13.22□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 26.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 GABARAPO95166 117 aa13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTHLHP12272 177 aa13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAT1P18440 290 aa13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CATR1Q13166 79 aa13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 IDO2Q6ZQW0 420 aa13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR5T1Q8NG75 326 aa13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 AP3S1Q92572 193 aa13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC5A7Q9GZV3 580 aa13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 COMMD3Q9UBI1 195 aa13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MSGN1A6NI15 193 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 OVOL1O14753 267 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 HRASP01112 189 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAS1LP35410 378 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 HERV-K104P61576 105 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2B11Q5JQS5 317 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MZT2AQ6P582 158 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHRS11Q6UWP2 260 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCUN1D4Q92564 292 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 USMG5Q96IX5 58 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCPEP1Q9HB40 452 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCL28Q9NRJ3 127 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 EHFQ9NZC4 300 aa13.21□□□□□ -0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNCP24821 2201 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A087WW49 117 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 MEIS3P1A6NDR6 274 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 KBTBD11O94819 623 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2A4O95047 310 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHV3-11P01762 117 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR9G9P0C7N8 305 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 DYRK1AQ13627 763 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTF1Q16619 201 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF429Q86V71 674 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC25A42Q86VD7 318 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR5H2Q8NGV7 314 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD300LFQ8TDQ1 290 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2A7Q96R45 310 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 COA4Q9NYJ1 87 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCOCQ9UIL1 159 aa13.2□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 MPPED1O15442 326 aa13.19□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 FCER2P06734 321 aa13.19□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZP3P21754 424 aa13.19□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 BRWD1-AS2P59051 145 aa13.19□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 FXYD4P59646 89 aa13.19□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPX8Q8TED1 209 aa13.19□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAM30Q9UKF2 790 aa13.19□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 SULT1C2O00338 296 aa13.18□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNFSF12O43508 249 aa13.18□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLURP1P55000 103 aa13.18□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEFB121Q5J5C9 76 aa13.18□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM17Q86X19 198 aa13.18□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPAG16Q8N0X2 631 aa13.18□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR4A5Q8NH83 315 aa13.18□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 MOB3AQ96BX8 217 aa13.18□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM223BA6NKX1 122 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 TPPPO94811 219 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGF2P09038 288 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELK1P19419 428 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 RCVRNP35243 200 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 RFX2P48378 723 aa13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms