RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566376.3

TCF4-233, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 462 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-233	ENST00000566376	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR5B12	Q96R08	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	PRR25	Q96S07	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	AGRN	O00468	2067 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376		A0A075B6Q4	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376		A0A087WWL8	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376		A0A1W2PN81	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376		E7EUB6	86 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SLC25A17	O43808	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR8U9	P0C7N5	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	EDN2	P20800	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SDC2	P34741	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	CHRNA7	P36544	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	DGCR2	P98153	550 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376		M0R1X1	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	BET1	O15155	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RGS11	O94810	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	DIRAS3	O95661	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	TFAP2A	P05549	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	MYOD1	P15172	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	VDAC1	P21796	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ZBTB25	P24278	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SLC6A1	P30531	599 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RAB9A	P51151	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SLC35B1	P78383	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF45	Q02386	682 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	MXD1	Q05195	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	NEDD8	Q15843	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	HACD4	Q5VWC8	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RBBP9	O75884	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	NXPH3	O95157	252 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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