RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 RPS25P62851 125 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 RCN1Q15293 331 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 HES5Q5TA89 166 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 TTC9CQ8N5M4 171 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 NECAP1Q8NC96 275 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 V9GY05 133 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 A0A075B6Q4 140 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 C2orf70A6NJV1 201 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 J3QRK9 145 aa12.79□□□□□ -0.36
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CS-214ENST00000548849 DIRAS3O95661 229 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
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CS-214ENST00000548849 C15orf32Q32M92 178 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 MMD2Q8IY49 270 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
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CS-214ENST00000548849 OR2C1O95371 312 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 GADD45AP24522 165 aa12.78□□□□□ -0.36
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CS-214ENST00000548849 CDK10Q15131 360 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 FAM209BQ5JX69 171 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 C10orf55Q5SWW7 151 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 SLC16A13Q7RTY0 426 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-214ENST00000548849 SLC25A42Q86VD7 318 aa12.78□□□□□ -0.36
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CS-214ENST00000548849 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
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CS-214ENST00000548849 FBXL7Q9UJT9 491 aa12.77□□□□□ -0.37
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CS-214ENST00000548849 LGALS9O00182 355 aa12.76□□□□□ -0.37
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CS-214ENST00000548849 CACNG8Q8WXS5 425 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 VCXQ9H320 206 aa12.76□□□□□ -0.37
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CS-214ENST00000548849 ZNF320A2RRD8 509 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 MFNGO00587 321 aa12.75□□□□□ -0.37
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CS-214ENST00000548849 OR52B4Q8NGK2 314 aa12.75□□□□□ -0.37
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CS-214ENST00000548849 OR51E2Q9H255 320 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa12.75□□□□□ -0.37
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CS-214ENST00000548849 TEX22C9J3V5 150 aa12.74□□□□□ -0.37
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CS-214ENST00000548849 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
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CS-214ENST00000548849 TMEM61Q8N0U2 210 aa12.74□□□□□ -0.37
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CS-214ENST00000548849 GGTLC1Q9BX51 225 aa12.74□□□□□ -0.37
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CS-214ENST00000548849 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 RPL30P62888 115 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 PMS2P11Q13670 270 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 Q6ZS49 121 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 UXS1Q8NBZ7 420 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 ACOT13Q9NPJ3 140 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 CXorf65A6NEN9 183 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 NPIPB5A8MRT5 1133 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-214ENST00000548849 E7EUB6 86 aa12.72□□□□□ -0.37
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