RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 OR2A4O95047 310 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SCTP09683 121 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 CD3GP09693 182 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 HSMCR30P0CW71 290 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 RRASP10301 218 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 RORCP51449 518 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 CD81P60033 236 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ATP5G2Q06055 141 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 UNC119Q13432 240 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TPBGQ13641 420 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 P2RY14Q15391 338 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 MED22Q15528 200 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 RAB11BQ15907 218 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 AP3S1Q92572 193 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 CYYR1Q96J86 154 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 HARBI1Q96MB7 349 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 Q9N2K0 584 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 RDH8Q9NYR8 311 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 HSF4Q9ULV5 492 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 MSGN1A6NI15 193 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 BET1O15155 118 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SOCS1O15524 211 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 BRI3O95415 125 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 CSN3P07498 182 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 GADD45AP24522 165 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ETV6P41212 452 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 NCS1P62166 190 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SPHARQ15513 63 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TNXAQ16473 311 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 GUCA2BQ16661 112 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 FAM209BQ5JX69 171 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 LAX1Q8IWV1 398 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 MFSD4AQ8N468 514 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 NEURL2Q9BR09 285 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 GINS4Q9BRT9 223 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 CENPOQ9BU64 300 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 PECRQ9BY49 303 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 OR2D2Q9H210 308 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 KCNK15Q9H427 330 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.43□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 DNAH2Q9P225 4427 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 A0A0A6YYD4 124 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 FAM223BA6NKX1 122 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SLC17A2O00624 439 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 FABP7O15540 132 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 PROP1O75360 226 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ARL6IP5O75915 188 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 OR9G9P0C7N8 305 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 APELAP0DMC3 54 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TALDO1P37837 337 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 LINC00205P59089 165 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 QRFPP83859 136 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 RHOGP84095 191 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 INSL4Q14641 139 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TRAM1Q15629 374 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TMEM177Q53S58 311 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TEX45Q8NA69 505 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 UFD1Q92890 307 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.42□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.41□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 CXorf65A6NEN9 183 aa6.41□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 OR11H12B2RN74 326 aa6.41□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 DEDDO75618 318 aa6.41□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 IGLV2-23P01705 113 aa6.41□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 CRYGBP07316 175 aa6.41□□□□□ -1.38
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