RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541175.1

PRR4-208, Transcript of proline rich 4, human

TSL 2

Gene PRR4, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-208	ENST00000541175	CRYGC	P07315	174 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	ATP5G3	P48201	142 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	GSS	P48637	474 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	MED20	Q9H944	212 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	LPA	P08519	4548 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	CHEK1	O14757	476 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	SULT1C4	O75897	302 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	GADD45G	O95257	159 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	MAS1	P04201	325 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	DEFA4	P12838	97 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	CAPG	P40121	348 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175		Q8N814	137 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	GALM	Q96C23	342 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	CMC2	Q9NRP2	79 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	CRYGB	P07316	175 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	OR2B8P	P59922	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	UBE2K	P61086	200 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	IRF3	Q14653	427 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	RSU1	Q15404	277 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	PRSS8	Q16651	343 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	ESRG	Q1W209	222 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	THYN1	Q9P016	225 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRR4-208	ENST00000541175	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	MT-ND2	P03891	347 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	HCCS	P53701	268 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms