RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539982.5

CLSTN3-209, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-209ENST00000539982 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 PRH1P02810 166 aa8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 HTR2CP28335 458 aa8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TRAM1Q15629 374 aa8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 FAM209BQ5JX69 171 aa8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TMEM203Q969S6 136 aa8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 SSR3Q9UNL2 185 aa8.67□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 PPP5D1E7EU14 171 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 M0R1X1 148 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 MPPED1O15442 326 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 OR2C1O95371 312 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 SCTP09683 121 aa8.66□□□□□ -1.02
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CLSTN3-209ENST00000539982 GALP22466 123 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 FABP5Q01469 135 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 ZNF45Q02386 682 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TMEM177Q53S58 311 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 GPHB5Q86YW7 130 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TEX45Q8NA69 505 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 NECAP1Q8NC96 275 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 HARBI1Q96MB7 349 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 UBE2CO00762 179 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 SHOXO15266 292 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 APOC4P55056 127 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 VBP1P61758 197 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 NCS1P62166 190 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 HLA-DRB3P79483 266 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 CBX3Q13185 183 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TNXAQ16473 311 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 PRSS8Q16651 343 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TM4SF20Q53R12 229 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 OR10K2Q6IF99 312 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 RNF183Q96D59 192 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 DERL3Q96Q80 235 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 CENPOQ9BU64 300 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TM2D1Q9BX74 207 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 MLXQ9UH92 298 aa8.65□□□□□ -1.02
CLSTN3-209ENST00000539982 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 PRR20EP86478 221 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 PRR20CP86479 221 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 PRR20DP86480 221 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 PRR20BP86481 221 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 PRR20AP86496 221 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 SPCS2Q15005 226 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 DEFB135Q30KP9 77 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 C15orf32Q32M92 178 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 NICN1Q9BSH3 213 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 Q9N2K0 584 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 RDH8Q9NYR8 311 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 AK3Q9UIJ7 227 aa8.64□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 ZNF320A2RRD8 509 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 TMEM213A2RRL7 107 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 OR2J3O76001 311 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 RRASP10301 218 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 TGFBR1P36897 503 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 SERPINB10P48595 397 aa8.63□□□□□ -1.03
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CLSTN3-209ENST00000539982 RTL8BQ17RB0 113 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 C22orf42Q6IC83 251 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 SPIN2AQ99865 258 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.63□□□□□ -1.03
CLSTN3-209ENST00000539982 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.63□□□□□ -1.03
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