RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522107.1

IGHV3-50-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-50 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-50, Length 317 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-50-201ENST00000522107 KIAA1456Q9P272 454 aa7.29□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.29□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.29□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.29□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 A0A1W2PN81 502 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 TEX22C9J3V5 150 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 M0QYG6 137 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 CCL24O00175 119 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 SULT1C2O00338 296 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 SHOXO15266 292 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 PF4V1P10720 104 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 CHRNA7P36544 502 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 LGALS7P47929 136 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 SLC35B1P78383 322 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 ZNF45Q02386 682 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 MSMO1Q15800 293 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 ZNF585BQ52M93 769 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 COMMD1Q8N668 190 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 TEX45Q8NA69 505 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 OR5T1Q8NG75 326 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 ARPC1AQ92747 370 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 MS4A10Q96PG2 267 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 IFT46Q9NQC8 304 aa7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
IGHV3-50-201ENST00000522107 FAM25AB3EWG3 89 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 FAM25CB3EWG5 89 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 FAM25GB3EWG6 89 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 IGKV1-39P01597 117 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 CD3DP04234 171 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 IGKV1D-39P04432 117 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 ZNF735P0CB33 412 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 MYCNOSP40205 109 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 PLGLAQ15195 96 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 RTL8BQ17RB0 113 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 LHFPL1Q86WI0 220 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 TMEM17Q86X19 198 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 RHOVQ96L33 236 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 HMX3A6NHT5 357 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 MSGN1A6NI15 193 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 DBX1A6NMT0 343 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 NUDT19A8MXV4 375 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 S1PR2O95136 353 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 TRBV12-3P01733 135 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 IGHV3-11P01762 117 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 PF4P02776 101 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 PRH1P02810 166 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 RRASP10301 218 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 RCVRNP35243 200 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 RUNX1Q01196 453 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 ACTBL2Q562R1 376 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 OR11H1Q8NG94 326 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 OR51H1Q8NH63 302 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 SCOCQ9UIL1 159 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.26□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 A0A087WW49 117 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 SLC22A5O76082 557 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 KBTBD11O94819 623 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 CD74P04233 296 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 RLN1P04808 185 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 RPA2P15927 270 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 PI3P19957 117 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 CD33P20138 364 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 SLURP1P55000 103 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 TNXAQ16473 311 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 POU2AF1Q16633 256 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 MZT2AQ6P582 158 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 SSX9Q7RTT3 188 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.25□□□□□ -1.25
IGHV3-50-201ENST00000522107 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms