RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, human

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLK-215	ENST00000514141	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	OR7C2	O60412	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	IAPP	P10997	89 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	TSPO	P30536	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	RBKS	Q9H477	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	SCT	P09683	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	CXCL2	P19875	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	GNG4	P50150	75 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	TCF15	Q12870	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	CCL19	Q99731	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	NPAS1	Q99742	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	CELA3A	P09093	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	TNXA	Q16473	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	SEC16A	O15027	2179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	FAM221A	A4D161	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	ISLR	O14498	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	NMB	P08949	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	OR5G3	P0C626	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	NPBWR2	P48146	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	LTC4S	Q16873	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	LYPD6	Q86Y78	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	CCL13	Q99616	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141		A0A1W2PRE2	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	TNFSF13	O75888	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	MYOD1	P15172	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	ADIRF	Q15847	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141		Q56UQ5	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141		A8MWL6	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	C3orf80	F5H4A9	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	ADAP1	O75689	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	CGA	P01215	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	ARG1	P05089	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	CXCL3	P19876	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	FAM168A	Q92567	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	METTL26	Q96S19	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLK-215	ENST00000514141	TMEM11	P17152	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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