RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNXAQ16473 311 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C11orf87Q6NUJ2 197 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF66Q6ZN08 573 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IDO2Q6ZQW0 420 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MMD2Q8IY49 270 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MFSD4AQ8N468 514 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPAN14Q8NG11 270 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR4C12Q96R67 309 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VCX3AQ9NNX9 186 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AIREO43918 545 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACTL6BO94805 426 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNFAIP8O95379 198 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR9G9P0C7N8 305 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF343Q6P1L6 599 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GVQW1Q8N7I0 195 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB34Q8NCN2 500 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 YIPF6Q96EC8 236 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPIN2AQ99865 258 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ELOVL1Q9BW60 279 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COA4Q9NYJ1 87 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XRCC3O43542 346 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LY86O95711 162 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPS19P39019 145 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR4S2Q8NH73 311 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GIMAP1Q8WWP7 306 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACOT12Q8WYK0 555 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MPPED1O15442 326 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR2A4O95047 310 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIR2DS2P43631 304 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRWD1-AS2P59051 145 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC9CQ8N5M4 171 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR5AP2Q8NGF4 316 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR2A7Q96R45 310 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AIFM2Q9BRQ8 373 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD34BA5PLL1 514 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HRASP01112 189 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPYP01298 95 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPNP16150 400 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAS1LP35410 378 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TGFBR1P36897 503 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DYRK1AQ13627 763 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TATDN3Q17R31 274 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR2B11Q5JQS5 317 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBE2NLQ5JXB2 153 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC25A42Q86VD7 318 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR13F1Q8NGS4 319 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SECTM1Q8WVN6 248 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCL28Q9NRJ3 127 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAS2R8Q9NYW2 309 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM223BA6NKX1 122 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KBTBD11O94819 623 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APELAP0DMC3 54 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTHLHP12272 177 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GP9P14770 177 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM223AQ8IWN6 122 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNAPC3Q92966 411 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM64CA6NLI5 447 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLV1-51P01701 117 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LSM3P62310 102 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM209BQ5JX69 171 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DHRS11Q6UWP2 260 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR9G4Q8NGQ1 327 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BORCS5Q969J3 196 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC25A46Q96AG3 418 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC5A7Q9GZV3 580 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AKIP1Q9NQ31 210 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TENM3Q9P273 2699 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RHOGP84095 191 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP5G2Q06055 141 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM69Q5SWH9 247 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPAG16Q8N0X2 631 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAMD12Q8N8I0 201 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NECAP1Q8NC96 275 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR4A5Q8NH83 315 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CMTM3Q96MX0 182 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFT46Q9NQC8 304 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC2A9Q9NRM0 540 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa12.87□□□□□ -0.35
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