RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CAD	P27708	2225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SVIL	O95425	2214 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SSSCA1	O60232	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	RAMP3	O60896	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	MED6	O75586	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DFFB	O76075	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	S1PR2	O95136	353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	GOSR1	O95249	250 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	HPRT1	P00492	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	GYPA	P02724	150 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	RBP4	P02753	201 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SLPI	P03973	132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SELL	P14151	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DAO	P14920	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	GATA3	P23771	443 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR12	P47775	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	THBS3	P49746	956 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SULT1A1	P50225	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	AKR1C2	P52895	323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	EDDM3B	P56851	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	VAMP2	P63027	116 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL8	P80075	99 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	MUC15	Q8N387	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP5S	Q99766	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	ATM	Q13315	3056 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GW64	132 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		I3L521	148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	WRB	O00258	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC31A2	O15432	143 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFB3	O43676	98 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PLAU	P00749	431 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ARG1	P05089	322 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	NQO2	P16083	231 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	IGFBP2	P18065	325 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	M6PR	P20645	277 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CAV2	P51636	162 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	DYNLT3	P51808	116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	F2RL1	P55085	397 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE2K	P61086	200 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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