RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359		H7C2Y5	167 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	AP4M1	O00189	453 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	LYRM1	O43325	122 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	OR2A4	O95047	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	SERPINE2	P07093	398 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359		P0C879	139 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	BTC	P35070	178 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	INPP1	P49441	399 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	PIGP	P57054	158 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	PROK1	P58294	105 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	FXYD4	P59646	89 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	BLCAP	P62952	87 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	SRPX	P78539	464 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	HES1	Q14469	280 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	MMD	Q15546	238 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	RITA1	Q96K30	269 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	RHOV	Q96L33	236 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359		A0A0B4J2A0	478 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	SHOX	O15266	292 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	FCGR3B	O75015	233 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	CRYZL1	O95825	349 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	SLC25A6	P12236	298 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	ANXA3	P12429	323 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	PGAM2	P15259	253 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	CD24	P25063	80 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	PAX6	P26367	422 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	LINC00205	P59089	165 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	DEFA1	P59665	94 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	DEFA3	P59666	94 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	CX3CL1	P78423	397 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	IFITM3	Q01628	133 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	LY6E	Q16553	131 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	PRSS8	Q16651	343 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359		H3BUA1	57 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFX1-205	ENST00000466359	UPK2	O00526	184 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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