RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 H7BYZ3 331 aa15.2■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 CRYAAP02489 173 aa15.2■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 CFHR2P36980 270 aa15.2■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 MOGAT3Q86VF5 341 aa15.2■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 ZADH2Q8N4Q0 377 aa15.2■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 WDR83OSQ9Y284 106 aa15.2■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 NBEAQ8NFP9 2946 aa15.19■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 C11orf94C9JXX5 98 aa15.19■□□□□ 0.02
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SYNE4-204ENST00000465425 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 MSMPQ1L6U9 139 aa15.19■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 PYY3Q5JQD4 70 aa15.19■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 VHLLQ6RSH7 139 aa15.19■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.19■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 OR10D4PQ8NGN7 298 aa15.19■□□□□ 0.02
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SYNE4-204ENST00000465425 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 GALR1P47211 349 aa15.18■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 AARDQ4LEZ3 155 aa15.18■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 GFI1BQ5VTD9 330 aa15.18■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 HIST3H2BBQ8N257 126 aa15.18■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 S100PBPQ96BU1 408 aa15.18■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 GPR61Q9BZJ8 451 aa15.18■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 SPRY3O43610 288 aa15.18■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 MPDU1O75352 247 aa15.18■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 LOXL3P58215 753 aa15.18■□□□□ 0.02
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SYNE4-204ENST00000465425 SEM1Q6ZVN7 128 aa15.18■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 MEGF10Q96KG7 1140 aa15.18■□□□□ 0.02
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SYNE4-204ENST00000465425 GAB2Q9UQC2 676 aa15.18■□□□□ 0.02
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SYNE4-204ENST00000465425 SOX15O60248 233 aa15.17■□□□□ 0.02
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SYNE4-204ENST00000465425 ZNF134P52741 427 aa15.17■□□□□ 0.02
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SYNE4-204ENST00000465425 OR52E5Q8NH55 327 aa15.17■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 IFI27L2Q9H2X8 130 aa15.17■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 SRD5A3Q9H8P0 318 aa15.17■□□□□ 0.02
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SYNE4-204ENST00000465425 CACNA1HO95180 2353 aa15.17■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa15.17■□□□□ 0.02
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SYNE4-204ENST00000465425 GLRXP35754 106 aa15.16■□□□□ 0.02
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SYNE4-204ENST00000465425 OR51G1Q8NGK1 321 aa15.16■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 RAB9BQ9NP90 201 aa15.16■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 PARD6AQ9NPB6 346 aa15.16■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM140Q9NV12 185 aa15.16■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 VENTXO95231 258 aa15.16■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 SPRNQ5BIV9 151 aa15.16■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 OR4S2Q8NH73 311 aa15.16■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 ITLN1Q8WWA0 313 aa15.16■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 RAB1CQ92928 201 aa15.16■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 DMRT1Q9Y5R6 373 aa15.16■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 PTPRBP23467 1997 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 RRHO14718 337 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 PDE6DO43924 150 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 FABP4P15090 132 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 RELBQ01201 579 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 CST9LP1Q5W188 147 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 TREML4Q6UXN2 200 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 PITPNC1Q9UKF7 332 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 PHOX2AO14813 284 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 HRASP01112 189 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 UBE2G2P60604 165 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 OR5T1Q8NG75 326 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 PFDN5Q99471 154 aa15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PPQ1 181 aa15.14■□□□□ 0.01
SYNE4-204ENST00000465425 GFRA3O60609 400 aa15.14■□□□□ 0.01
SYNE4-204ENST00000465425 CEACAM4O75871 244 aa15.14■□□□□ 0.01
SYNE4-204ENST00000465425 OPRK1P41145 380 aa15.14■□□□□ 0.01
SYNE4-204ENST00000465425 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SYNE4-204ENST00000465425 OR4X1Q8NH49 305 aa15.14■□□□□ 0.01
SYNE4-204ENST00000465425 LEAP2Q969E1 77 aa15.14■□□□□ 0.01
SYNE4-204ENST00000465425 PYGO2Q9BRQ0 406 aa15.14■□□□□ 0.01
SYNE4-204ENST00000465425 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SYNE4-204ENST00000465425 TRAV3A0A0B4J244 114 aa15.14■□□□□ 0.01
SYNE4-204ENST00000465425 SLC31A2O15432 143 aa15.14■□□□□ 0.01
SYNE4-204ENST00000465425 LHBP01229 141 aa15.14■□□□□ 0.01
SYNE4-204ENST00000465425 BMP5P22003 454 aa15.14■□□□□ 0.01
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