RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 HARBI1Q96MB7 349 aa8.15□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.15□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 RAB18Q9NP72 206 aa8.15□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SHOXO15266 292 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 NBR2O15453 112 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 FGF16O43320 207 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 PEX14O75381 377 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 S1PR2O95136 353 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SPDEFO95238 335 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 HPRT1P00492 218 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV1-39P01597 117 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV1D-39P04432 117 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 CRYGBP07316 175 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 OR5AC1P0C628 307 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 UCP1P25874 307 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 LPAR6P43657 344 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 LGALS7P47929 136 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TAS2R31P59538 309 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 DHODHQ02127 395 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SP6Q3SY56 376 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 C11orf88Q6PI97 169 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 REC114Q7Z4M0 266 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 ENKURQ8TC29 256 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 GALNT14Q96FL9 552 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 C1RLQ9NZP8 487 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 COMMD9Q9P000 198 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 M0QZK8 103 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 RRHO14718 337 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SLC25A17O43808 307 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 B3GALNT1O75752 331 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SPNP16150 400 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 UBE2KP61086 200 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 BLCAPP62952 87 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 PPP1R1AQ13522 171 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 POU2AF1Q16633 256 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 Q6ZS46 218 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SGPP2Q8IWX5 399 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 GLYATL2Q8WU03 294 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 FBXL15Q9H469 300 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF702PQ9H963 129 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 NUDT15Q9NV35 164 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 PRR13Q9NZ81 148 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 NF1P21359 2839 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SFT2D2O95562 160 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 CDS2O95674 445 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 PTTG1O95997 202 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 HRASP01112 189 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 CRYBA1P05813 215 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 OR4E1P0C645 316 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 NQO2P16083 231 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM187Q14656 261 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TRIM16LQ309B1 348 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 Q6ZSV7 163 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 Q8N2B8 174 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TEX45Q8NA69 505 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 LHFPL5Q8TAF8 219 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 R3HDM4Q96D70 268 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM56Q96MV1 263 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 BEX1Q9HBH7 125 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 KIAA1456Q9P272 454 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 C9orf170A2RU37 121 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 MARCH11A6NNE9 402 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 FCN1O00602 326 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TSPAN9O75954 239 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms