RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BVESQ8NE79 360 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZMAT4Q9H898 229 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A0B4J203 849 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00473A8K010 186 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRBV12-3P01733 135 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DTYMKP23919 212 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DEFA5Q01523 94 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRSS8Q16651 343 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TEX45Q8NA69 505 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 USMG5Q96IX5 58 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GINS4Q9BRT9 223 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CENPOQ9BU64 300 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 COA4Q9NYJ1 87 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.17□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A075B6Q4 140 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MSGN1A6NI15 193 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR2A4O95047 310 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CRYZL1O95825 349 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 APELAP0DMC3 54 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB3BP20337 219 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MYL9P24844 172 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HSPA13P48723 471 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SYNJ2BPP57105 145 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARL6IP1Q15041 203 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CNBD2Q96M20 576 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VCX3BQ9H321 246 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM223BA6NKX1 122 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H0Y980 276 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGLV2-14P01704 120 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HLA-DQB1P01920 261 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CSN3P07498 182 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR9G9P0C7N8 305 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LYL1P12980 280 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TALDO1P37837 337 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GABARAPL2P60520 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF45Q02386 682 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARFRP1Q13795 201 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CDK10Q15131 360 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TNXAQ16473 311 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HACD4Q5VWC8 232 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C22orf42Q6IC83 251 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PHB2Q99623 299 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DBX1A6NMT0 343 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BMPR1BO00238 502 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CTXN2P0C2S0 81 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RHOGP84095 191 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPEL1Q2QD12 228 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CDNFQ49AH0 187 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LCN12Q6JVE5 192 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KCTD9Q7L273 389 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MMD2Q8IY49 270 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q8N402 240 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SNAPC3Q92966 411 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SPIN2AQ99865 258 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB26Q9ULW5 256 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.14□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.13□□□□□ -1.27
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SMIM30A4D0T7 59 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.3 ms