RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 SYNGR2O43760 224 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 CHST1O43916 411 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 S1PR2O95136 353 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 ARG1P05089 322 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 MSMBP08118 114 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 G6PCP35575 357 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 S100A10P60903 97 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 SPCS3P61009 180 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 TEX45Q8NA69 505 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 CLCC1Q96S66 551 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 MBD2Q9UBB5 411 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 CACNG5Q9UF02 275 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 PRNDQ9UKY0 176 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 FAM157AC9JC47 383 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 H0YIZ8 118 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 TSC22D2O75157 780 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 CRYZL1O95825 349 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 SCGB1D2O95969 90 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 BRS3P32247 399 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 MAS1LP35410 378 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2KP61086 200 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 BAXQ07812 192 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 OPCMLQ14982 345 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 UTF1Q5T230 341 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZRM9 215 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 SLC51BQ86UW2 128 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 TEX29Q8N6K0 151 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 ARL6Q9H0F7 186 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 MMP26Q9NRE1 261 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 AUP1Q9Y679 476 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 UPK2O00526 184 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 TSPAN9O75954 239 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 JTBO76095 146 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 KBTBD11O94819 623 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 SPDEFO95238 335 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 IFNA7P01567 189 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 HKR1P10072 659 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 CXCL2P19875 107 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 COX7A1P24310 79 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 RELBQ01201 579 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 TNFRSF9Q07011 255 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 HCP5Q6MZN7 132 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 MOB3BQ86TA1 216 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 OR2C3Q8N628 320 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 OR5B3Q8NH48 314 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 REG4Q9BYZ8 158 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM140Q9NV12 185 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 MED13LQ71F56 2210 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0G2JRQ6 117 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-211ENST00000425989 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-211ENST00000425989 RGS13O14921 159 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-211ENST00000425989 IFNA17P01571 189 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-211ENST00000425989 FAM106CPP0CH98 169 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-211ENST00000425989 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00205P59089 165 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP10-9P60411 292 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-211ENST00000425989 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-211ENST00000425989 EBI3Q14213 229 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-211ENST00000425989 ATP6V1FQ16864 119 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-211ENST00000425989 OR4A47Q6IF82 309 aa7.77□□□□□ -1.17
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