RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF146Q15072 292 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 RFESDQ8TAC1 157 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV4-34P06331 123 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 P2RY4P51582 365 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 ATOH7Q8N100 152 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 RAB1CQ92928 201 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 GPR82Q96P67 336 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 MED13Q9UHV7 2174 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 C1QL1O75973 258 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 PIGYQ3MUY2 71 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.13□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 NEU1Q99519 415 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 DENND4AQ7Z401 1863 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 PPBPP02775 128 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 SFTPCP11686 197 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 ASIPP42127 132 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 ADRA2AP08913 450 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 C14orf144Q96I85 54 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1B0GW64 132 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 RRHO14718 337 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 CCL11P51671 97 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 FUT5Q11128 374 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 TIMP4Q99727 224 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 TET1Q8NFU7 2136 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 FGF12P61328 243 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 BIVMQ86UB2 503 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 CEACAM5P06731 702 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 PRR13Q9NZ81 148 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.12□□□□□ -1.27
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PKHD1-201ENST00000340994 TMPRSS2O15393 492 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 RRN3P1Q2M238 152 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 GPR146Q96CH1 333 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 VWA8A3KMH1 1905 aa7.12□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 H3BUT2 72 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 TBR1Q16650 682 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 C17orf99Q6UX52 265 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 TNFSF13O75888 250 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 OBSL1O75147 1896 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 GDF9O60383 454 aa7.11□□□□□ -1.27
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PKHD1-201ENST00000340994 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 WNT5AP41221 380 aa7.11□□□□□ -1.27
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PKHD1-201ENST00000340994 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 MED13LQ71F56 2210 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 EFNB2P52799 333 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM160Q9NX00 188 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 SLC25A20O43772 301 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 C16orf92Q96LL3 132 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PKHD1-201ENST00000340994 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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