RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 PTGDSP41222 190 aa20.63■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 GALNT14Q96FL9 552 aa20.63■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 EGR4Q05215 589 aa20.63■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 SHISA3A0PJX4 238 aa20.63■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 CBLN1P23435 193 aa20.63■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa20.62■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 BIVMQ86UB2 503 aa20.62■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4D5Q8NGN0 318 aa20.62■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 EGR1P18146 543 aa20.62■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS2R60P59551 318 aa20.62■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 ARF6P62330 175 aa20.62■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.62■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 VENTXO95231 258 aa20.61■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 KLK15Q9H2R5 256 aa20.61■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa20.61■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 HBBP68871 147 aa20.61■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR82Q96P67 336 aa20.61■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 COX6A1P12074 109 aa20.61■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM250H0YL14 139 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4C13Q8NGP0 309 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 OR5P3Q8WZ94 311 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNL4K9M1U5 179 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 RRHO14718 337 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A45Q8N413 288 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 C17orf51A8MQB3 221 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 KLF4O43474 513 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 CTAG1AP78358 180 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 RELQ04864 619 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 RRN3P1Q2M238 152 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFA2O43678 99 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 PRSS2P07478 247 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 CRYBA2P53672 197 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 C10orf128Q5T292 105 aa20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 THY1P04216 161 aa20.59■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 NPIPB3Q92617 1050 aa20.59■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 MSGN1A6NI15 193 aa20.59■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 NPCDR1Q9BY65 106 aa20.59■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.59■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 DPRXA6NFQ7 191 aa20.58■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa20.58■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 PPIAL4GP0DN37 164 aa20.58■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM186Q96B77 213 aa20.58■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 RPRMQ9NS64 109 aa20.58■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 NKX2-8O15522 239 aa20.58■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC32Q5I0X7 151 aa20.58■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 OR9G1Q8NH87 305 aa20.58■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 LINC00305Q7Z4B0 112 aa20.58■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM13P0DJ93 91 aa20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 GPX1P07203 203 aa20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 PCSK4Q6UW60 755 aa20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 IGHV3-48P01763 117 aa20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 DDB2Q92466 427 aa20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 MCM3APO60318 1980 aa20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 ARID1AO14497 2285 aa20.57■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 MOSP00540 346 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 CTSSP25774 331 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM30BQ3MIR4 351 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXJ2Q9P0K8 574 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A0G2JK05 382 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 A1L4Q6 167 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 NPIPB13A6NJU9 1138 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 NPIPB4C9JG80 1138 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 LCN2P80188 198 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP5G2Q06055 141 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 A8MXK9 166 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 PLSCR2Q9NRY7 297 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 EMP1P54849 157 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 C1QL2Q7Z5L3 287 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 WDYHV1Q96HA8 205 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF600Q6ZNG1 722 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 COPS9Q8WXC6 57 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 KNL1Q8NG31 2342 aa20.56■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 CA7P43166 264 aa20.55■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 PCP4P48539 62 aa20.55■□□□□ 0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 PCOLCEQ15113 449 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms