RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 OR2C3Q8N628 320 aa7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 PTX4Q96A99 478 aa7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 HARBI1Q96MB7 349 aa7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 MGLLQ99685 303 aa7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 MLXQ9UH92 298 aa7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.71□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 DNAH2Q9P225 4427 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TMEM213A2RRL7 107 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 PPP5D1E7EU14 171 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 OR2C1O95371 312 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 APELAP0DMC3 54 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CD36P16671 472 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 GALP22466 123 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 MED22Q15528 200 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 C15orf32Q32M92 178 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 MARC2Q969Z3 335 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 GHRLQ9UBU3 117 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 FBXL17Q9UF56 701 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 APLNQ9ULZ1 77 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.7□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ZNF320A2RRD8 509 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 C11orf94C9JXX5 98 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SHOXO15266 292 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 XRCC3O43542 346 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 NAPSAO96009 420 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 PRH1P02810 166 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CTRB1P17538 263 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SERPINB10P48595 397 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 LINC00205P59089 165 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TRAM1Q15629 374 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TNXAQ16473 311 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CTF1Q16619 201 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 Q499Y3 187 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TMEM177Q53S58 311 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 BTNL8Q6UX41 500 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TEX45Q8NA69 505 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SETD6Q8TBK2 473 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 UFD1Q92890 307 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ORAI1Q96D31 301 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SMIM19Q96E16 107 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 GALNT14Q96FL9 552 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SPIN2AQ99865 258 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.69□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 M0R1X1 148 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 LIMS3P0CW19 117 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 LIMS4P0CW20 117 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 C8orf88P0DMB2 117 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 RRASP10301 218 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ARL3P36405 182 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 UBE2KP61086 200 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TPBGQ13641 420 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 PRSS8Q16651 343 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CYYR1Q96J86 154 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 RARRES2Q99969 163 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.68□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 IGLL5B9A064 214 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 OGG1O15527 345 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 OR2J3O76001 311 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ACTL6BO94805 426 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CD1AP06126 327 aa7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms