RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 HPRT1P00492 218 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 NRGNQ92686 78 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 TXNL1O43396 289 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 P2RY1P47900 373 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 THBS3P49746 956 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 OR9G1Q8NH87 305 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 R3HDM4Q96D70 268 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB39BQ96DA2 213 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 CREBBPQ92793 2442 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV1-47P01700 117 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV2-5P01817 119 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 RBP4P02753 201 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV1-16P04430 117 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 LIPFP07098 398 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF137PP52743 207 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 REG1BP48304 166 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 NHLH2Q02577 135 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 NMBP08949 121 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 OR9G9P0C7N8 305 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 KIR2DS2P43631 304 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 LMO4P61968 165 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2C3Q8N628 320 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 REG4Q9BYZ8 158 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPN13Q12923 2485 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 TNCP24821 2201 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 IGSF23A1L1A6 192 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 ARF6P62330 175 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 PAX2Q02962 417 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR157Q5UAW9 335 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 SSX9Q7RTT3 188 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4S2Q8NH73 311 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXL17Q9UF56 701 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 POLQO75417 2590 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PPH5 198 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 SYNGR2O43760 224 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR137BO60478 399 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 COX6B1P14854 86 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 COL8A1P27658 744 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFRSF9Q07011 255 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 STOML3Q8TAV4 291 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM186Q96B77 213 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP9P14780 707 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 NQO2P16083 231 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 AARDQ4LEZ3 155 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 WFDC1Q9HC57 220 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 H0YJW9 148 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 WRBO00258 174 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 CAV2P51636 162 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 CLINT1Q14677 625 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 NABP2Q9BQ15 211 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 AUP1Q9Y679 476 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 H3BP45 60 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2KP61086 200 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 HCP5Q6MZN7 132 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFRSF14Q92956 283 aa7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.6 ms