RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	GTR1	Q00582	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	TOF2	Q02208	771 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SHE9	Q04172	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	VAC14	Q06708	880 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	NTG2	Q08214	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	VHS3	Q08438	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	MDY2	Q12285	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	BI4	P03879	638 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
MSC7	YHR039C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	CBP3	P21560	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MDL1	P33310	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MSN4	P33749	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	APM3	P38153	483 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MMS4	P38257	691 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	APM2	P38700	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MTG2	P38860	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PMT3	P47190	753 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ASE1	P50275	885 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	LCL3	P53153	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PIB2	P53191	635 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YNR061C	P53747	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YNR068C	P53754	272 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MRPL19	P53875	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PRB1	P09232	635 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	DBF2	P22204	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	NPR1	P22211	790 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SED4	P25365	1065 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YKL069W	P36088	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PCH2	P38126	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RAD55	P38953	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	OSW5	P40219	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	HLJ1	P48353	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SAM50	P53969	484 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	VPS9	P54787	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	BET4	Q00618	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RMI1	Q02685	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MUK1	Q02866	612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PEX25	Q02969	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YEH2	Q07950	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YOL036W	Q08206	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ENV9	Q08651	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	DIN7	Q12086	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	IML1	P47170	1584 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	HSF1	P10961	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PDX1	P16451	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SAN1	P22470	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YHI9	P38765	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RCY1	P39531	840 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	QDR2	P40474	542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	TED1	P40533	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	STR2	P47164	639 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	TEL2	P53038	688 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MRPL50	P53724	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RMD1	Q03441	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MMP1	Q12372	583 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	VMR1	P38735	1592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MET3	P08536	511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RAP1	P11938	827 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RSR1	P13856	272 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SEC63	P14906	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MNE1	P24720	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
MSC7	YHR039C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	NPL6	P32832	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	CAF4	P36130	643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ERT1	P38140	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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