RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641447.1

MFSD8-231, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-231	ENST00000641447	CRK	P46108	304 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	SOX10	P56693	466 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	TNNI2	P48788	182 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	BCAM	P50895	628 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	GRIK5	Q16478	980 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	EYA2	O00167	538 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	FGFR2	P21802	821 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	GJA5	P36382	358 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	MAST3	O60307	1309 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	SLC5A1	P13866	664 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	LPIN2	Q92539	896 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MFSD8-231	ENST00000641447	CENPF	P49454	3210 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	CACNB3	P54284	484 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	CRHR2	Q13324	411 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	VGLL4	Q14135	290 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	PTPN18	Q99952	460 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	HTT	P42858	3142 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	CIAO1	O76071	339 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.38	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	SIL1	Q9H173	461 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	GTF2A2	P52657	109 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	SP3	Q02447	781 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	CCL15	Q16663	113 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MFSD8-231	ENST00000641447	SEMA3E	O15041	775 aa		13.34	□□□□□ -0.27

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