RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	PFKFB1	P16118	471 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT222	Q8N1A0	295 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	GPS2	Q13227	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	RTN1	Q16799	776 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	PLIN2	Q99541	437 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	ERBB3	P21860	1342 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC5A1	P13866	664 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP7A1	P22680	504 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPIN3-223	ENST00000639525	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	CARD6	Q9BX69	1037 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	DNA2	P51530	1060 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	DACH1	Q9UI36	760 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ELP1	O95163	1332 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	IL2RB	P14784	551 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	MCM6	Q14566	821 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	WASF1	Q92558	559 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	MYL5	Q02045	173 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	NLRP5	P59047	1200 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	DESI2	Q9BSY9	194 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC66	A2RUB6	948 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	FANCL	Q9NW38	375 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	GREM2	Q9H772	168 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	N4BP3	O15049	544 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	CLSTN1	O94985	981 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF174	Q15697	407 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	PHACTR2	O75167	634 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	TXLNA	P40222	546 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	PHKA1	P46020	1223 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	SCARF1	Q14162	830 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	PTPRU	Q92729	1446 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525		G3V3G9	751 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	EXOC5	O00471	708 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	KIF5C	O60282	957 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	ERCC3	P19447	782 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-223	ENST00000639525	NLRP12	P59046	1061 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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