RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 ALDH1A1P00352 501 aa26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3-208ENST00000616074 IFNL1Q8IU54 200 aa26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC3-208ENST00000616074 FKTNO75072 461 aa26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3-208ENST00000616074 INHBEP58166 350 aa26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3-208ENST00000616074 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC3-208ENST00000616074 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3-208ENST00000616074 GJA5P36382 358 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3-208ENST00000616074 TEPSINQ96N21 525 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.08■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 BCAMP50895 628 aa26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 FGFR2P21802 821 aa26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 ELP3Q9H9T3 547 aa26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 HTTP42858 3142 aa26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 TNNI2P48788 182 aa26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIF16BQ96L93 1317 aa26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 EYA2O00167 538 aa26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 TEKT1Q969V4 418 aa26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 OPTNQ96CV9 577 aa26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3-208ENST00000616074 CACNB3P54284 484 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 PTPN18Q99952 460 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 CRHR2Q13324 411 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 VGLL4Q14135 290 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC5A1P13866 664 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAP3K9P80192 1104 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 LPIN2Q92539 896 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 MRIQ9BWK5 157 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRIM17Q9Y577 477 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAST3O60307 1309 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 CENPFP49454 3210 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 SIL1Q9H173 461 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3-208ENST00000616074 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 CSADQ9Y600 493 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM83AQ86UY5 434 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 ERO1AQ96HE7 468 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC34A2O95436 690 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 OTUD5Q96G74 571 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 FBXO3Q9UK99 471 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 CIAO1O76071 339 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 GTF2A2P52657 109 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCL15Q16663 113 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATP2B3Q16720 1220 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 WRNIP1Q96S55 665 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 CAP1Q01518 475 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 SP3Q02447 781 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRDX5P30044 214 aa25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3-208ENST00000616074 HOOK2Q96ED9 719 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3-208ENST00000616074 MEIS3Q99687 375 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3-208ENST00000616074 EFCC1Q9HA90 598 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3-208ENST00000616074 AK9Q5TCS8 1911 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3-208ENST00000616074 BRCA2P51587 3418 aa25.88■■□□□ 1.73
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