RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615329.4

RPS6KC1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,022 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-209ENST00000615329 NEFHP12036 1026 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CAVIN2O95810 425 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CYP21A2P08686 494 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 TERF2Q15554 542 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 COPS6Q7L5N1 327 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 LINS1Q8NG48 757 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 ZEB2O60315 1214 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 ALDH1L1O75891 902 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CABP4P57796 275 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 SPECC1Q5M775 1068 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 AKAP12Q02952 1782 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 DIP2AQ14689 1571 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 SPA17Q15506 151 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 EPC1Q9H2F5 836 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 MYO1BO43795 1136 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 MAP9Q49MG5 647 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 METTL24Q5JXM2 366 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 IQCB1Q15051 598 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 NDUFA8P51970 172 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 TIMM10P62072 90 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 KDRP35968 1356 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 LONRF3Q496Y0 759 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 NAPBQ9H115 298 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CTAGE8P0CG41 777 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CEP57Q86XR8 500 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 IP6K1Q92551 441 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 HINFPQ9BQA5 517 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 SPTLC2O15270 562 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 SLFN14P0C7P3 912 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 GCP02774 474 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 PAFAH1B1P43034 410 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CLIC4Q9Y696 253 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CLCN6P51797 869 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CCZ1BP86790 482 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 TNNI3KQ59H18 835 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 ALG1Q9BT22 464 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 ADCY9O60503 1353 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.58□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.58□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 GOPCQ9HD26 462 aa14.58□□□□□ -0.07
RPS6KC1-209ENST00000615329 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.079e-7■□□□□ 9.9
RPS6KC1-209ENST00000615329 SLIT1O75093 1534 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-209ENST00000615329 A0A0G2JLW4 131 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-209ENST00000615329 YEATS4O95619 227 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-209ENST00000615329 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-209ENST00000615329 ATP1A3P13637 1013 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-209ENST00000615329 FANCCQ00597 558 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-209ENST00000615329 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-209ENST00000615329 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-209ENST00000615329 TAF4BQ92750 862 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 805.5 ms