RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP7D2Q96T17 732 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BCAMP50895 628 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PIP4K2BP78356 416 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AK7Q96M32 723 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYH3P11055 1940 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CPLX1O14810 134 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 B4E1Z4 1266 aa25.45■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NTSR2O95665 410 aa25.45■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RXRAP19793 462 aa25.45■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LUZP1Q86V48 1076 aa25.45■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RCOR1Q9UKL0 485 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MBD4O95243 580 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PARP10Q53GL7 1025 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM5Q71RC9 77 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C8orf76Q96K31 380 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARMT1Q9H993 441 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SENP2Q9HC62 589 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATRNO75882 1429 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP3K12Q12852 859 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NEDD4P46934 1319 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ME1P48163 572 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARID3AQ99856 593 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHRNDQ07001 517 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRP5O75197 1615 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KLHL34Q8N239 644 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CBX8Q9HC52 389 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRKAB2O43741 272 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NAPBQ9H115 298 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DYNC1I1O14576 645 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPC24Q8NBT2 197 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MICU3Q86XE3 530 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AIFM3Q96NN9 605 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYH7P12883 1935 aa25.39■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.39■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.39■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYL10Q9BUA6 226 aa25.39■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLIC4Q9Y696 253 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERFEQ4G0M1 354 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCORLQ8N3X6 602 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FSIP1Q8NA03 581 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NRAPQ86VF7 1730 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BARGINQ6ZT62 677 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF28PB7ZC32 967 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDC27P30260 824 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATL3Q6DD88 541 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHKBQ93100 1093 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZMYM6O95789 1325 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A087WWV3 80 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 APOA5Q6Q788 366 aa25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms