RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 SDF4Q9BRK5 362 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 WDR19Q8NEZ3 1342 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 E7EWF7 191 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 IP6K1Q92551 441 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 SOX12O15370 315 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 PPP6R2O75170 966 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 TC2NQ8N9U0 490 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 RNMTO43148 476 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 ZNF18P17022 549 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 UBASH3AP57075 661 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 TUBB4BP68371 445 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 C19orf44Q9H6X5 657 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 LRP6O75581 1613 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 NEURL1BA8MQ27 555 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 IVLP07476 585 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 FECHP22830 423 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 TUBB2AQ13885 445 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 TUBB2BQ9BVA1 445 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 LRRC2Q9BYS8 371 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 TMEM232C9JQI7 657 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 POTEB2H3BUK9 544 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 CPP00450 1065 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 SLC39A14Q15043 492 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 EPHA10Q5JZY3 1008 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 GORABQ5T7V8 394 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 ANO1Q5XXA6 986 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-242ENST00000602319 KIF28PB7ZC32 967 aa11.4□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 STK38Q15208 465 aa11.4□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 PTPAQ15257 358 aa11.4□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.4□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 RESP18Q5W5W9 173 aa11.4□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 ANKRD24Q8TF21 1146 aa11.4□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 EPC1Q9H2F5 836 aa11.4□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 CHGBP05060 677 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 ALS2Q96Q42 1657 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 CUTAO60888 179 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 GCKRQ14397 625 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 NBPF4Q96M43 638 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 MAP3K14Q99558 947 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 SIL1Q9H173 461 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 CPDO75976 1380 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 TIAM2Q8IVF5 1701 aa11.39□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 TRIM66O15016 1216 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 TOP1P11387 765 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 NLRP6P59044 892 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 DHX58Q96C10 678 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 GPR108Q9NPR9 543 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 CCT2P78371 535 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 L1RE1Q9UN81 338 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 LTKP29376 864 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 CASP7P55210 303 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 TFCP2Q12800 502 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 SHC4Q6S5L8 630 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 PANX2Q96RD6 677 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 BRMS1Q9HCU9 246 aa11.38□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 FOXP2O15409 715 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 MAGEA9P43362 315 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 KLHDC4Q8TBB5 520 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 CHD4Q14839 1912 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 UBR2Q8IWV8 1755 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 A0A0G2JLW4 131 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-242ENST00000602319 BMP6P22004 513 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms