RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 MAP3K9P80192 1104 aa21.45■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 VGLL4Q14135 290 aa21.45■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.45■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.45■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 TNNI2P48788 182 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 UBE4AQ14139 1066 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.43■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 F6X3S4 739 aa21.43■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 VAMP4O75379 141 aa21.43■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 GYG1P46976 350 aa21.43■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.43■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 CSADQ9Y600 493 aa21.43■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 GRM8O00222 908 aa21.42■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 CRKP46108 304 aa21.42■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.42■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 OTUD5Q96G74 571 aa21.42■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.41■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.41■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
FCHO1-230ENST00000600058 TLR2O60603 784 aa21.39■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 CETPP11597 493 aa21.39■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.39■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 SZT2Q5T011 3432 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 KIF22Q14807 665 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 ERO1BQ86YB8 467 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 GNRH1P01148 92 aa21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 GRIK5Q16478 980 aa21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC184Q52MB2 194 aa21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 BTBD19C9JJ37 291 aa21.36■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 ALDH1L1O75891 902 aa21.36■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 PRMT2P55345 433 aa21.36■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 SNAPC2Q13487 334 aa21.36■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.36■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.36■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 H0YGN5 161 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 CACNB3P54284 484 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 VPS37DQ86XT2 251 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 WDR63Q8IWG1 891 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 TEKT1Q969V4 418 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 HOOK2Q96ED9 719 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 WRNIP1Q96S55 665 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 IRF6O14896 467 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 PPIL2Q13356 520 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 FAM83AQ86UY5 434 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 KAZALD1Q96I82 304 aa21.33■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.33■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 MRIQ9BWK5 157 aa21.33■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.33■■□□□ 1.01
FCHO1-230ENST00000600058 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 SUCLG2Q96I99 432 aa21.32■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.31■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 DCAF15Q66K64 600 aa21.31■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 C17orf99Q6UX52 265 aa21.31■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 PPATQ06203 517 aa21.3■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.3■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 SHISA4Q96DD7 197 aa21.3■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 MAST3O60307 1309 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 MTFR1Q15390 333 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 SRRDQ9UH36 339 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 UTYO14607 1347 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.28■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 PDE8BO95263 885 aa21.28■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 CTGFP29279 349 aa21.28■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
FCHO1-230ENST00000600058 METTL24Q5JXM2 366 aa21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms