RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 MCOLN1Q9GZU1 580 aa29.04■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 UNCXA6NJT0 531 aa29.03■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 TM4SF4P48230 202 aa29.03■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 SIL1Q9H173 461 aa29.03■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 FZD1Q9UP38 647 aa29.03■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa29.03■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 OTOFQ9HC10 1997 aa29.02■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 SPRYD7Q5W111 196 aa29.01■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 TEKT1Q969V4 418 aa29.01■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 COPRSQ9NQ92 184 aa29.01■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 MAST3O60307 1309 aa29■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 GNAI3P08754 354 aa29■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 SREBF2Q12772 1141 aa29■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 DGKZQ13574 1117 aa29■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 MRIQ9BWK5 157 aa29■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 CEP126Q9P2H0 1117 aa29■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 TRIM27P14373 513 aa28.99■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 ATP2B3Q16720 1220 aa28.99■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 MIER1Q8N108 512 aa28.99■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.98■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 SLC10A4Q96EP9 437 aa28.98■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.98■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.97■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 CLMNQ96JQ2 1002 aa28.97■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 TEPSINQ96N21 525 aa28.97■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 USP2O75604 605 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 TNNI2P48788 182 aa28.96■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 MTX1Q13505 466 aa28.96■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 WNK4Q96J92 1243 aa28.96■■■□□ 2.23
MBD3-211ENST00000592965 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.95■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 BCAR3O75815 825 aa28.95■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 ZBTB22O15209 634 aa28.94■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.94■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa28.94■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 CFHR5Q9BXR6 569 aa28.94■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 CCDC85CA6NKD9 419 aa28.93■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.93■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.93■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.93■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 SEMA3EO15041 775 aa28.92■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 SRGAP3O43295 1099 aa28.92■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 INHBEP58166 350 aa28.92■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.92■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 TNNQ9UQP3 1299 aa28.92■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 TBC1D8O95759 1140 aa28.91■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
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MBD3-211ENST00000592965 FAM83AQ86UY5 434 aa28.9■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 SALL1Q9NSC2 1324 aa28.9■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 GNAI2P04899 355 aa28.89■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 PHKA1P46020 1223 aa28.89■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 CACNB3P54284 484 aa28.89■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.89■■■□□ 2.22
MBD3-211ENST00000592965 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 ADORA1P30542 326 aa28.88■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.88■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.88■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 GPR25O00155 361 aa28.87■■■□□ 2.21
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MBD3-211ENST00000592965 IFNL1Q8IU54 200 aa28.87■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
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MBD3-211ENST00000592965 CCDC102BQ68D86 513 aa28.86■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.86■■■□□ 2.21
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MBD3-211ENST00000592965 MYH2Q9UKX2 1941 aa28.85■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 LDHBP07195 334 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 ELP3Q9H9T3 547 aa28.85■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.85■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 MAP3K9P80192 1104 aa28.84■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 TFCP2Q12800 502 aa28.84■■■□□ 2.21
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MBD3-211ENST00000592965 DIXDC1Q155Q3 683 aa28.84■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.84■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 HOOK2Q96ED9 719 aa28.84■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa28.84■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 A0A1B0GUL7 405 aa28.83■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 RGS19P49795 217 aa28.83■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 TIMM10P62072 90 aa28.83■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
MBD3-211ENST00000592965 OPTNQ96CV9 577 aa28.83■■■□□ 2.21
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