RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 TCP10L2B9ZVM9 353 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC24Q50LG9 513 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO33Q7Z6M2 555 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CD99L2Q8TCZ2 262 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM39BQ9GZU3 492 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD44Q8N8A2 993 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ERO1AQ96HE7 468 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 HTTP42858 3142 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CAP1Q01518 475 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A4AQ96JQ5 239 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF521Q96K83 1311 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL24Q5JXM2 366 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS37DQ86XT2 251 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 VGLL2Q8N8G2 317 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN22Q9Y2R2 807 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 VGLL4Q14135 290 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEFA5A3E0 1075 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 TNNI2P48788 182 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP32.29■■■□□ 2.768e-20■■□□□ 14.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNB3P54284 484 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 SP3Q02447 781 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHDC4Q8TBB5 520 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 BRI3BPQ8WY22 251 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE8BO95263 885 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K9P80192 1104 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 CAVIN4Q5BKX8 364 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 EFCC1Q9HA90 598 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDH10Q9P2E7 1040 aa32.26■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 BCAMP50895 628 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 TEKT1Q969V4 418 aa32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL15Q16663 113 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 OTUD5Q96G74 571 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CSADQ9Y600 493 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2A2P52657 109 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRCP08575 1304 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM43AQ8N2R8 423 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMC5Q96C12 935 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC15Q96MV8 337 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 USP44Q9H0E7 712 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDYE5A6NIY4 337 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 FGFR2P21802 821 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-211ENST00000590874 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 SSH1Q8WYL5 1049 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 WRNIP1Q96S55 665 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 MRIQ9BWK5 157 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TMOD2Q9NZR1 351 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF16BQ96L93 1317 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM83AQ86UY5 434 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 MAST3O60307 1309 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 EN2P19622 333 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP1CQ5VVH2 108 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPFP49454 3210 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 HHIPL2Q6UWX4 724 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ERO1BQ86YB8 467 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-211ENST00000590874 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 EYA2O00167 538 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 IRF6O14896 467 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF333Q96JL9 665 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 E9PSI1 815 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 CETPP11597 493 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 BTBD19C9JJ37 291 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC5A1P13866 664 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 HOOK2Q96ED9 719 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 BRCA2P51587 3418 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SNAPC2Q13487 334 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF6Q15052 776 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 MIGA2Q7L4E1 593 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 LPIN2Q92539 896 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 TLR2O60603 784 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIL2Q13356 520 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF15Q66K64 600 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG9AQ7Z3C6 839 aa32.09■■■□□ 2.73
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