RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DIP2BQ9P265 1576 aa8.81□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAPKBP1O60336 1514 aa8.8□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GIPC1O14908 333 aa8.8□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CABP4P57796 275 aa8.8□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.8□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FRMD6Q96NE9 622 aa8.8□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AK5Q9Y6K8 562 aa8.8□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SAMD9Q5K651 1589 aa8.8□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ABCA8O94911 1581 aa8.79□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A0A0MRY4 1105 aa8.79□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ITPKAP23677 461 aa8.79□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMC4Q7Z404 712 aa8.79□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.79□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.79□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.79□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.79□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KIF21BO75037 1637 aa8.79□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H3BRJ5 948 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COL8A1P27658 744 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IKBKEQ14164 716 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SETDB1Q15047 1291 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HGSNATQ68CP4 663 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF576Q9H609 170 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MRS2Q9HD23 443 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.77□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FSCN2O14926 492 aa8.77□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SORBS3O60504 671 aa8.77□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP17L7P0C7H9 530 aa8.77□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GSTT1P30711 240 aa8.77□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RAC1P63000 192 aa8.77□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.77□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UACAQ9BZF9 1416 aa8.77□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PCDH1Q08174 1060 aa8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF428Q96B54 188 aa8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.76□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EEA1Q15075 1411 aa8.75□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.75□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAAP100Q0VG06 881 aa8.75□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FBXO11Q86XK2 927 aa8.75□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ASXL2Q76L83 1435 aa8.74□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PIP4K2BP78356 416 aa8.74□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GRIK4Q16099 956 aa8.74□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.74□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.74□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.74□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TSPOAP1O95153 1857 aa8.74□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.73□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FBXO24O75426 580 aa8.73□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CTSHP09668 335 aa8.73□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARL4DP49703 201 aa8.73□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.73□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.73□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BCL11AQ9H165 835 aa8.73□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UNCXA6NJT0 531 aa8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DLL1O00548 723 aa8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TM4SF5O14894 197 aa8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ELNP15502 786 aa8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GSTM4Q03013 218 aa8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WNT8BQ93098 351 aa8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATP10BO94823 1461 aa8.71□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 B3GALT4O96024 378 aa8.71□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NLRP12P59046 1061 aa8.71□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms