RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589769.1

EFTUD2-214, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-214ENST00000589769 DDIT3P35638 169 aa18.09■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 RUFY3Q7L099 469 aa18.09■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.09■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.493e-7■□□□□ 8.4
EFTUD2-214ENST00000589769 COA1Q9GZY4 146 aa18.09■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 RAI14Q9P0K7 980 aa18.09■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 ABCF2Q9UG63 623 aa18.09■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa18.09■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 CYP7A1P22680 504 aa18.08■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 ADGRA1Q86SQ6 560 aa18.08■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 EYA3Q99504 573 aa18.08■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 C6orf229H3BNL8 230 aa18.07■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 PRDX5P30044 214 aa18.07■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 MECOMQ03112 1051 aa18.07■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.07■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 STOX1Q6ZVD7 989 aa18.07■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 LCORLQ8N3X6 602 aa18.07■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 FGAP02671 866 aa18.06■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 RPS6KB1P23443 525 aa18.06■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 CUL4AQ13619 759 aa18.06■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.06■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 OLFM4Q6UX06 510 aa18.06■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.06■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 SGIP1Q9BQI5 828 aa18.06■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 NAV1Q8NEY1 1877 aa18.05■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 FOCADQ5VW36 1801 aa18.05■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa18.05■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 POLD1P28340 1107 aa18.05■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 AK2P54819 239 aa18.05■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 TMX3Q96JJ7 454 aa18.05■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 NEK1Q96PY6 1258 aa18.05■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 ARMT1Q9H993 441 aa18.05■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa18.05■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 MYH2Q9UKX2 1941 aa18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 GSG1L2A8MUP6 293 aa18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 ZBTB7AO95365 584 aa18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 KCNA3P22001 575 aa18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 TTLL5Q6EMB2 1281 aa18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 PDRG1Q9NUG6 133 aa18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.03■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 A0A0G2JLW4 131 aa18.03■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 E7EWF7 191 aa18.03■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 CPA1P15085 419 aa18.03■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 TGFB2P61812 414 aa18.03■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 GSTO1P78417 241 aa18.03■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 TTLL6Q8N841 843 aa18.03■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 MIGA1Q8NAN2 632 aa18.03■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 NBPF3Q9H094 633 aa18.03■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 SCN9AQ15858 1988 aa18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 DPEP1P16444 411 aa18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 ANKRD1Q15327 319 aa18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 CERS3Q8IU89 383 aa18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 FBXL16Q8N461 479 aa18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-214ENST00000589769 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa18.01■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 GAKO14976 1311 aa18.01■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.01■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC93Q567U6 631 aa18.01■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 PSMD1Q99460 953 aa18.01■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 AGXT2Q9BYV1 514 aa18.01■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 NAPBQ9H115 298 aa18.01■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 JAG2Q9Y219 1238 aa18.01■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa18.01■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF213O14771 459 aa18■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 MFSD14BQ5SR56 506 aa18■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 PODNQ7Z5L7 613 aa18■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18■□□□□ 0.47
EFTUD2-214ENST00000589769 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms