RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 MBD4O95243 580 aa23.57■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.57■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 KLHL34Q8N239 644 aa23.57■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 ARMT1Q9H993 441 aa23.57■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.57■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 RNF20Q5VTR2 975 aa23.56■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 CHD4Q14839 1912 aa23.55■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 CYP21A2P08686 494 aa23.55■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 NEK4P51957 841 aa23.55■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 GTF2IP78347 998 aa23.55■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.55■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 FGAP02671 866 aa23.55■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 CCDC93Q567U6 631 aa23.55■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 LCORLQ8N3X6 602 aa23.55■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.55■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 G3V3G9 751 aa23.54■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.54■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.54■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.54■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.54■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.53■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.53■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.53■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 AOC3Q16853 763 aa23.53■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 PODNQ7Z5L7 613 aa23.53■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 HSCBQ8IWL3 235 aa23.53■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.53■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 PRKAB2O43741 272 aa23.52■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 APPP05067 770 aa23.52■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.52■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.52■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.52■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 IGSF3O75054 1194 aa23.51■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 CPA1P15085 419 aa23.51■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 SPON1Q9HCB6 807 aa23.51■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.51■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 ST18O60284 1047 aa23.51■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 FBXW7Q969H0 707 aa23.51■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 PSMD1Q99460 953 aa23.51■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.51■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.51■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.5■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.5■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.5■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.5■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 ECE2O60344 883 aa23.49■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.49■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 PPIP5K2O43314 1243 aa23.49■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 GNAT2P19087 354 aa23.49■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 CERS5Q8N5B7 392 aa23.49■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 MXD3Q9BW11 206 aa23.49■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 SOGA3Q5TF21 947 aa23.48■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.48■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.48■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.47■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 HAND2P61296 217 aa23.47■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 KRT32Q14532 448 aa23.47■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 ALX1Q15699 326 aa23.47■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 TTC14Q96N46 770 aa23.47■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 PSMA5P28066 241 aa23.47■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 GSTO1P78417 241 aa23.47■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 RUFY3Q7L099 469 aa23.47■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.47■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 BCS1LQ9Y276 419 aa23.46■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.46■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 E7EWF7 191 aa23.45■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 ZNF213O14771 459 aa23.45■■□□□ 1.35
PGS1-211ENST00000589425 LDHCP07864 332 aa23.45■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.45■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 NEK1Q96PY6 1258 aa23.45■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 NAPBQ9H115 298 aa23.45■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.45■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.44■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 ZMYM6O95789 1325 aa23.44■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 YDJCA8MPS7 323 aa23.44■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.44■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.44■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 SCN9AQ15858 1988 aa23.44■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 F8W031 263 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms