RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	RNF34	Q969K3	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-222	ENST00000588494	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIK3R2	O00459	728 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	GNB5	O14775	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	B3GALT4	O96024	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ITGB7	P26010	798 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	NLRP12	P59046	1061 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	RAC1	P63000	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRIM11	Q96F44	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	FANCC	Q00597	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	SULF2	Q8IWU5	870 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ENC1	O14682	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	PAGE1	O75459	146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	KCNB2	Q92953	911 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	CORO1B	Q9BR76	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP11A1	P05108	521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	NME2	P22392	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAOB	P27338	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	LIG3	P49916	1009 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	POU4F3	Q15319	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	WNT8B	Q93098	351 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ECEL1	O95672	775 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	RLBP1	P12271	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARNT	P27540	789 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	PWP1	Q13610	501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	GRIK4	Q16099	956 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP21	Q9UK80	565 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADAM11	O75078	769 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRRC14	Q15048	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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