RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587324.1

UBXN6-204, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-204ENST00000587324 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 GRM8O00222 908 aa23.81■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 SP3Q02447 781 aa23.81■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.81■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 KAZALD1Q96I82 304 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.8■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.79■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 VGLL4Q14135 290 aa23.79■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 GCC1Q96CN9 775 aa23.79■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 TNFAIP1Q13829 316 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 SUCLG2Q96I99 432 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF333Q96JL9 665 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 CRKP46108 304 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 UBE4AQ14139 1066 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN6-204ENST00000587324 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.76■■□□□ 1.39
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UBXN6-204ENST00000587324 CCL15Q16663 113 aa23.76■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 MRS2Q9HD23 443 aa23.76■■□□□ 1.39
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UBXN6-204ENST00000587324 WDR63Q8IWG1 891 aa23.75■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 CACNB3P54284 484 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 OTUD5Q96G74 571 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 MAP3K9P80192 1104 aa23.73■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.73■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 ALDH1L1O75891 902 aa23.72■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.72■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.71■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 GTF2A2P52657 109 aa23.71■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 LRRC24Q50LG9 513 aa23.71■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.71■■□□□ 1.39
UBXN6-204ENST00000587324 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.7■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.7■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 AK9Q5TCS8 1911 aa23.7■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 UTYO14607 1347 aa23.69■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.69■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.69■■□□□ 1.38
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UBXN6-204ENST00000587324 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
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UBXN6-204ENST00000587324 TNNI2P48788 182 aa23.68■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.67■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.67■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 MGAMO43451 1857 aa23.66■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 IRF6O14896 467 aa23.66■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 CTGFP29279 349 aa23.66■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 WRNIP1Q96S55 665 aa23.66■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 TLR2O60603 784 aa23.65■■□□□ 1.38
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UBXN6-204ENST00000587324 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 ERO1BQ86YB8 467 aa23.65■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.65■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 TEKT1Q969V4 418 aa23.65■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.65■■□□□ 1.38
UBXN6-204ENST00000587324 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
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UBXN6-204ENST00000587324 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.63■■□□□ 1.37
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UBXN6-204ENST00000587324 VPS37DQ86XT2 251 aa23.63■■□□□ 1.37
UBXN6-204ENST00000587324 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.63■■□□□ 1.37
UBXN6-204ENST00000587324 SHISA4Q96DD7 197 aa23.63■■□□□ 1.37
UBXN6-204ENST00000587324 PTPRFP10586 1907 aa23.63■■□□□ 1.37
UBXN6-204ENST00000587324 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.62■■□□□ 1.37
UBXN6-204ENST00000587324 DOCK2Q92608 1830 aa23.62■■□□□ 1.37
UBXN6-204ENST00000587324 PDE8BO95263 885 aa23.62■■□□□ 1.37
UBXN6-204ENST00000587324 INPP5BP32019 993 aa23.62■■□□□ 1.37
UBXN6-204ENST00000587324 NBPF11Q86T75 865 aa23.62■■□□□ 1.37
UBXN6-204ENST00000587324 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
UBXN6-204ENST00000587324 FGFR2P21802 821 aa23.61■■□□□ 1.37
UBXN6-204ENST00000587324 SNAPC2Q13487 334 aa23.61■■□□□ 1.37
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