RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2-208ENST00000587269 SPDYE2Q495Y8 402 aa36.75■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 LDLRAD1Q5T700 205 aa36.75■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 MCOLN1Q9GZU1 580 aa36.75■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 CIAO1O76071 339 aa36.74■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 TEKT1Q969V4 418 aa36.74■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 FZD1Q9UP38 647 aa36.74■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 MEIS3Q99687 375 aa36.73■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 MAST3O60307 1309 aa36.73■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 ATG9AQ7Z3C6 839 aa36.72■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa36.72■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 TCP10L2B9ZVM9 353 aa36.71■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 IL15P40933 162 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.71■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 ATP2B3Q16720 1220 aa36.71■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 MIER1Q8N108 512 aa36.71■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 WDR66Q8TBY9 1149 aa36.71■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 TMOD2Q9NZR1 351 aa36.71■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 AOX1Q06278 1338 aa36.7■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 UNCXA6NJT0 531 aa36.7■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 TM4SF4P48230 202 aa36.7■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 MAP3K11Q16584 847 aa36.7■■■■□ 3.47
SMAD2-208ENST00000587269 SPRYD7Q5W111 196 aa36.69■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 GRIK5Q16478 980 aa36.68■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa36.67■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 MRIQ9BWK5 157 aa36.67■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 ARAP2Q8WZ64 1704 aa36.66■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 TBC1D8O95759 1140 aa36.66■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 SRGAP3O43295 1099 aa36.65■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 BCAR3O75815 825 aa36.65■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 INHBEP58166 350 aa36.65■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa36.65■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 COPRSQ9NQ92 184 aa36.65■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 USP2O75604 605 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 CLMNQ96JQ2 1002 aa36.64■■■■□ 3.46
SMAD2-208ENST00000587269 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 TRIM27P14373 513 aa36.63■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 CLUAP1Q96AJ1 413 aa36.63■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 ZDHHC15Q96MV8 337 aa36.63■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 ALDH1A1P00352 501 aa36.62■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 WNK4Q96J92 1243 aa36.62■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 TMEM39BQ9GZU3 492 aa36.62■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 GNAI2P04899 355 aa36.61■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 HHIPL2Q6UWX4 724 aa36.61■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 DENND2AQ9ULE3 1009 aa36.61■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 SSC5DA1L4H1 1573 aa36.61■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 AKAP2Q9Y2D5 859 aa36.6■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa36.59■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 HOOK2Q96ED9 719 aa36.59■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 MYH13Q9UKX3 1938 aa36.58■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 SEMA3EO15041 775 aa36.58■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 LDHBP07195 334 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 CACNB3P54284 484 aa36.58■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa36.58■■■■□ 3.45
SMAD2-208ENST00000587269 TEPSINQ96N21 525 aa36.57■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 ELP3Q9H9T3 547 aa36.56■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 CSADQ9Y600 493 aa36.56■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 GPR25O00155 361 aa36.55■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 FKBP1CQ5VVH2 108 aa36.55■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 PHKA1P46020 1223 aa36.54■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 MAP3K9P80192 1104 aa36.54■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 FAM83AQ86UY5 434 aa36.54■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 IFNL1Q8IU54 200 aa36.54■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 TIMM10P62072 90 aa36.53■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 MTX1Q13505 466 aa36.53■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 TFCP2Q12800 502 aa36.52■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP36.52■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 CCDC102BQ68D86 513 aa36.52■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 CDAN1Q8IWY9 1227 aa36.52■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 NEUROD6Q96NK8 337 aa36.52■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 TNNQ9UQP3 1299 aa36.52■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 FKTNO75072 461 aa36.51■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 ADORA1P30542 326 aa36.51■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 GORABQ5T7V8 394 aa36.51■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 OPTNQ96CV9 577 aa36.51■■■■□ 3.44
SMAD2-208ENST00000587269 PRDX5P30044 214 aa36.5■■■■□ 3.43
SMAD2-208ENST00000587269 MVPQ14764 893 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
SMAD2-208ENST00000587269 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
SMAD2-208ENST00000587269 A0A1B0GUL7 405 aa36.49■■■■□ 3.43
SMAD2-208ENST00000587269 DIXDC1Q155Q3 683 aa36.49■■■■□ 3.43
SMAD2-208ENST00000587269 DCAF15Q66K64 600 aa36.49■■■■□ 3.43
SMAD2-208ENST00000587269 TMEM57Q8N5G2 664 aa36.49■■■■□ 3.43
SMAD2-208ENST00000587269 CFHR5Q9BXR6 569 aa36.49■■■■□ 3.43
SMAD2-208ENST00000587269 XAGE2Q96GT9 111 aa36.48■■■■□ 3.43
SMAD2-208ENST00000587269 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa36.48■■■■□ 3.43
SMAD2-208ENST00000587269 SALL1Q9NSC2 1324 aa36.48■■■■□ 3.43
SMAD2-208ENST00000587269 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
SMAD2-208ENST00000587269 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms