RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 G2E3Q7L622 706 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 CHMP3Q9Y3E7 222 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 DLL1O00548 723 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 PLIN1O60240 522 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 SLC4A2P04920 1241 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 SLC17A8Q8NDX2 589 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 TEPSINQ96N21 525 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 LAMB1P07942 1786 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 MYH3P11055 1940 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 BTBD19C9JJ37 291 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 TAF7LQ5H9L4 462 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 NKX2-3Q8TAU0 364 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 HTATIP2Q9BUP3 242 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 FAM205AQ6ZU69 1335 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 HOXD10P28358 340 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 CRKP46108 304 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 FLIIQ13045 1269 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 SNAPC2Q13487 334 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 MTFR1Q15390 333 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 ERO1BQ86YB8 467 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 LINS1Q8NG48 757 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 DNAAF4Q8WXU2 420 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 SHISA4Q96DD7 197 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 CNNM1Q9NRU3 951 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 NR2E3Q9Y5X4 410 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 ECM29Q5VYK3 1845 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 PSMC4P43686 418 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 FOXO4P98177 505 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC57Q2TAC2 916 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 RAET1EQ8TD07 263 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 WRNIP1Q96S55 665 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 SZT2Q5T011 3432 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRM-210ENST00000578916 IRF6O14896 467 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 GRK4P32298 578 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 GYG1P46976 350 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 GJA8P48165 433 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 PPIL2Q13356 520 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 UBE4AQ14139 1066 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 LMBR1LQ6UX01 489 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 C17orf99Q6UX52 265 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 HOOK2Q96ED9 719 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 TRIM47Q96LD4 638 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 SRRDQ9UH36 339 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 CPA4Q9UI42 421 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 GJB1P08034 283 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 CCL5P13501 91 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 OSBPP22059 807 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 UBXN2AP68543 259 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 RNF208Q9H0X6 261 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 OTOFQ9HC10 1997 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 MYPNQ86TC9 1320 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 CTGFP29279 349 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 CACNB3P54284 484 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 PPATQ06203 517 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 DCAF15Q66K64 600 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 VPS37DQ86XT2 251 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 TEKT1Q969V4 418 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 PRO3102Q9H379 93 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 PDHXO00330 501 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 EPHA10Q5JZY3 1008 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 FAM83AQ86UY5 434 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.55□□□□□ -0.56
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