RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577796.5

RAB31-204, Transcript of RAB31, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB31, Length 295 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB31-204	ENST00000577796	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB31-204	ENST00000577796	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB31-204	ENST00000577796	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB31-204	ENST00000577796	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB31-204	ENST00000577796	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RAB31-204	ENST00000577796	SLAIN2	Q9P270	581 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB31-204	ENST00000577796	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	METTL12	A8MUP2	240 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	PDGFA	P04085	211 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	BNIP3	Q12983	259 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	CYP27A1	Q02318	531 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	MAP7	Q14244	749 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	DYM	Q7RTS9	669 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	PMEPA1	Q969W9	287 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	LGR6	Q9HBX8	967 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	BIN1	O00499	593 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	MAOB	P27338	520 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	FAM168A	Q92567	244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	PHACTR2	O75167	634 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	TNFRSF21	O75509	655 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	ECEL1	O95672	775 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	EDN3	P14138	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	PCSK2	P16519	638 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	CD96	P40200	585 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	CD8B	P10966	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	ATP2B4	P23634	1241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	MPST	P25325	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	ASPA	P45381	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	PKN1	Q16512	942 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	TTC16	Q8NEE8	873 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	POLI	Q9UNA4	740 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-204	ENST00000577796	ATG7	O95352	703 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	FUT4	P22083	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	POU4F3	Q15319	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796		U3KQE9	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	MTMR3	Q13615	1198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796		A0A096LPE4	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	CYP11A1	P05108	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	GRIA4	P48058	902 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	MESP2	Q0VG99	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	NETO1	Q8TDF5	533 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-204	ENST00000577796	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms