RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 VEZTQ9HBM0 779 aa26■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 PDE3AQ14432 1141 aa25.99■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 CEP85Q6P2H3 762 aa25.99■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.98■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 FKBP1BP68106 108 aa25.98■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.98■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.97■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 RGMBQ6NW40 437 aa25.96■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 AIDAQ96BJ3 306 aa25.96■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 MRIQ9BWK5 157 aa25.96■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 GPR108Q9NPR9 543 aa25.96■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 PCNTO95613 3336 aa25.95■■□□□ 1.75
SNAP23-216ENST00000568331 ZBTB22O15209 634 aa25.95■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 TNFAIP1Q13829 316 aa25.95■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.95■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.95■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.94■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 MAP2K2P36507 400 aa25.94■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.94■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 AOX1Q06278 1338 aa25.93■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 AOC2O75106 756 aa25.93■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 HMMRO75330 724 aa25.93■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 RASGRF1Q13972 1273 aa25.93■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 TNNI3KQ59H18 835 aa25.93■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.93■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC102AQ96A19 550 aa25.93■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.93■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.93■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 TNNI2P48788 182 aa25.92■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.92■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.92■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.92■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.92■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.91■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 PRDX5P30044 214 aa25.91■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 NOGQ13253 232 aa25.91■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 RASA3Q14644 834 aa25.91■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.91■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.91■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.91■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 ABCF2Q9UG63 623 aa25.91■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.9■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 PRKG1Q13976 671 aa25.9■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 MOB2Q70IA6 237 aa25.9■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 WBP1LQ9NX94 342 aa25.9■■□□□ 1.74
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SNAP23-216ENST00000568331 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.89■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.89■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.89■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.89■■□□□ 1.74
SNAP23-216ENST00000568331 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 SPATA5Q8NB90 893 aa25.88■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.87■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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SNAP23-216ENST00000568331 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.87■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.87■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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SNAP23-216ENST00000568331 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.86■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.86■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 FOXN1O15353 648 aa25.85■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 SLC10A3P09131 477 aa25.85■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 CACNB3P54284 484 aa25.85■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.84■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 MCAMP43121 646 aa25.83■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 PI16Q6UXB8 463 aa25.83■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.83■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.83■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.83■■□□□ 1.73
SNAP23-216ENST00000568331 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.82■■□□□ 1.72
SNAP23-216ENST00000568331 APBB1O00213 710 aa25.82■■□□□ 1.72
SNAP23-216ENST00000568331 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SNAP23-216ENST00000568331 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SNAP23-216ENST00000568331 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SNAP23-216ENST00000568331 FAM83AQ86UY5 434 aa25.82■■□□□ 1.72
SNAP23-216ENST00000568331 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SNAP23-216ENST00000568331 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SNAP23-216ENST00000568331 FZD1Q9UP38 647 aa25.82■■□□□ 1.72
SNAP23-216ENST00000568331 AK9Q5TCS8 1911 aa25.82■■□□□ 1.72
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