RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	SCN9A	Q15858	1988 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	PTMS	P20962	102 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	ATP2B4	P23634	1241 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	GYG1	P46976	350 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	ATP2B3	Q16720	1220 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	BRD1	O95696	1058 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	GORAB	Q5T7V8	394 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	JAG2	Q9Y219	1238 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		12.08	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	YDJC	A8MPS7	323 aa		12.08	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	LARGE1	O95461	756 aa		12.08	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	PSMA5	P28066	241 aa		12.08	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	SCARF1	Q14162	830 aa		12.08	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		12.08	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		12.08	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.47
TCF4-231	ENST00000566279	ECE2	O60344	883 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	FGFR2	P21802	821 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	MAST3	O60307	1309 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	RAD17	O75943	681 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	NIM1K	Q8IY84	436 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	EYA3	Q99504	573 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	LAMA4	Q16363	1823 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	RPS6KB1	P23443	525 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	BCAM	P50895	628 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	UBE4A	Q14139	1066 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	JDP2	Q8WYK2	163 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279		G3V3G9	751 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ZAP70	P43403	619 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ST3GAL1	Q11201	340 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	KRT32	Q14532	448 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	MCTP1	Q6DN14	999 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	FBXW7	Q969H0	707 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	MXD3	Q9BW11	206 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279		M0R2C6	588 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	CYP21A2	P08686	494 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	MCAM	P43121	646 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	PI16	Q6UXB8	463 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	SLC5A1	P13866	664 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	PHKA1	P46020	1223 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ME3	Q16798	604 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	LPIN2	Q92539	896 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	OSBP2	Q969R2	916 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	CD209	Q9NNX6	404 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	FZD9	O00144	591 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	CXCL9	Q07325	125 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ANKRD1	Q15327	319 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	NEK1	Q96PY6	1258 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	PSME4	Q14997	1843 aa		12.03	□□□□□ -0.48

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