RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561292.1

PRTG-204, Transcript of protogenin, human

TSL 3 BASIC

Gene PRTG, Length 833 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRTG-204	ENST00000561292	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
PRTG-204	ENST00000561292	TNN	Q9UQP3	1299 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PRTG-204	ENST00000561292	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PRTG-204	ENST00000561292	TRPA1	O75762	1119 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PRTG-204	ENST00000561292	RASA3	Q14644	834 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PRTG-204	ENST00000561292	COPRS	Q9NQ92	184 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PRTG-204	ENST00000561292	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PRTG-204	ENST00000561292	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PRTG-204	ENST00000561292	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PRTG-204	ENST00000561292	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PRTG-204	ENST00000561292	MAP3K11	Q16584	847 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PRTG-204	ENST00000561292	ATP2B3	Q16720	1220 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	29.26	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	TNFAIP1	Q13829	316 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	ABHD8	Q96I13	439 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	MTX1	Q13505	466 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	TEKT1	Q969V4	418 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	MRI	Q9BWK5	157 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	SRGAP3	O43295	1099 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	TM4SF4	P48230	202 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	MAST3	O60307	1309 aa		29.2	■■■□□ 2.27
PRTG-204	ENST00000561292	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	SPRYD7	Q5W111	196 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	TEPSIN	Q96N21	525 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	UNCX	A6NJT0	531 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	GNAI2	P04899	355 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	TNNI2	P48788	182 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	PHKA1	P46020	1223 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	SREBF2	Q12772	1141 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	ADORA1	P30542	326 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	CACNB3	P54284	484 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	DGKZ	Q13574	1117 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	WNK4	Q96J92	1243 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	SEMA3E	O15041	775 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	ZBTB22	O15209	634 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	TIMM10	P62072	90 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	TFCP2	Q12800	502 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	CCDC102B	Q68D86	513 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PRTG-204	ENST00000561292	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	TBC1D8	O95759	1140 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	PRDX5	P30044	214 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292		A0A1B0GUL7	405 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	FAM83A	Q86UY5	434 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	OTOF	Q9HC10	1997 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	XAGE2	Q96GT9	111 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	LAMB1	P07942	1786 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	GJA5	P36382	358 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	INHBE	P58166	350 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	RASGRF1	Q13972	1273 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PRTG-204	ENST00000561292	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	29.07	■■■□□ 2.24
PRTG-204	ENST00000561292	ELP3	Q9H9T3	547 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PRTG-204	ENST00000561292	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PRTG-204	ENST00000561292	ALDH1A1	P00352	501 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PRTG-204	ENST00000561292	RLBP1	P12271	317 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PRTG-204	ENST00000561292	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	29.06	■■■□□ 2.24
PRTG-204	ENST00000561292	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PRTG-204	ENST00000561292	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PRTG-204	ENST00000561292	IFNL1	Q8IU54	200 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PRTG-204	ENST00000561292	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PRTG-204	ENST00000561292	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PRTG-204	ENST00000561292	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
PRTG-204	ENST00000561292	GPR25	O00155	361 aa		29.05	■■■□□ 2.24

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