RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	KANK3	Q6NY19	840 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	PANK1	Q8TE04	598 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	NLRP7	Q8WX94	980 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	MTFR1L	Q9H019	292 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	USP44	Q9H0E7	712 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	RTL9	Q8NET4	1388 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	HMMR	O75330	724 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	NTSR2	O95665	410 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ST5	P78524	1137 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	NFIX	Q14938	502 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	CNBD1	Q8NA66	436 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	COG6	Q9Y2V7	657 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	PDE8A	O60658	829 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	POLD1	P28340	1107 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	CASP7	P55210	303 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	SVOP	Q8N4V2	548 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	NPHP1	O15259	732 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	SERPINB2	P05120	415 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	TIMP2	P16035	220 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	GPT	P24298	496 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	PDE6B	P35913	854 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	SH3BP2	P78314	561 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	NNT	Q13423	1086 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	SUSD4	Q5VX71	490 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	TMC4	Q7Z404	712 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	NLRP3	Q96P20	1036 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	CRBN	Q96SW2	442 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	MEIS3	Q99687	375 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		7.16	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	CSF1R	P07333	972 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	MMP10	P09238	476 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ATP8B2	P98198	1209 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	PHOX2B	Q99453	314 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CHP1-208	ENST00000560965	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		7.15	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	LRP5	O75197	1615 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	ZMYND10	O75800	440 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	ADH1C	P00326	375 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	JUND	P17535	347 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	CTSW	P56202	376 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	TGFB2	P61812	414 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	USP46	P62068	366 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	CRY2	Q49AN0	593 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	CEP85	Q6P2H3	762 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	SSH3	Q8TE77	659 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	GCC1	Q96CN9	775 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	FAM89A	Q96GI7	184 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	SPON1	Q9HCB6	807 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	TNN	Q9UQP3	1299 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	SRGAP3	O43295	1099 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	ARHGEF15	O94989	841 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	CD46	P15529	392 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CHP1-208	ENST00000560965	ALDH1B1	P30837	517 aa		7.13	□□□□□ -1.27

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