RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560622.5

USP3-AS1-207, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-207ENST00000560622 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.43■□□□□ 0.86
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USP3-AS1-207ENST00000560622 MYO1BO43795 1136 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 ALDH1A1P00352 501 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 CRKP46108 304 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 INHBEP58166 350 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.42■□□□□ 0.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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USP3-AS1-207ENST00000560622 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.42■□□□□ 0.86
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USP3-AS1-207ENST00000560622 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
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USP3-AS1-207ENST00000560622 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.41■□□□□ 0.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 USP44Q9H0E7 712 aa20.41■□□□□ 0.86
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USP3-AS1-207ENST00000560622 CRHR2Q13324 411 aa20.4■□□□□ 0.86
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USP3-AS1-207ENST00000560622 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.4■□□□□ 0.86
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USP3-AS1-207ENST00000560622 ELP3Q9H9T3 547 aa20.39■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 BCAMP50895 628 aa20.38■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
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USP3-AS1-207ENST00000560622 PTPRCP08575 1304 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 CACNB3P54284 484 aa20.37■□□□□ 0.85
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USP3-AS1-207ENST00000560622 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRIM17Q9Y577 477 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.37■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 CEP290O15078 2479 aa20.36■□□□□ 0.85
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USP3-AS1-207ENST00000560622 TNFAIP1Q13829 316 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 METTL24Q5JXM2 366 aa20.36■□□□□ 0.85
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USP3-AS1-207ENST00000560622 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.36■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIF16BQ96L93 1317 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 POTEFA5A3E0 1075 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLFN5Q08AF3 891 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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USP3-AS1-207ENST00000560622 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.35■□□□□ 0.85
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USP3-AS1-207ENST00000560622 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 MRIQ9BWK5 157 aa20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.34■□□□□ 0.85
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USP3-AS1-207ENST00000560622 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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USP3-AS1-207ENST00000560622 E9PSI1 815 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 EYA2O00167 538 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 TEKT1Q969V4 418 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARMC5Q96C12 935 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 ERO1AQ96HE7 468 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 SP3Q02447 781 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM83AQ86UY5 434 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 SZT2Q5T011 3432 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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USP3-AS1-207ENST00000560622 CCL15Q16663 113 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 VPS37DQ86XT2 251 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 OTUD5Q96G74 571 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 TNNI2P48788 182 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 EFCC1Q9HA90 598 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 GTF2A2P52657 109 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 IRF6O14896 467 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 LPIN2Q92539 896 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 WRNIP1Q96S55 665 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 BTBD19C9JJ37 291 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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