RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 CACNA1FO60840 1977 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 OTUD5Q96G74 571 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.16■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 BEND3Q5T5X7 828 aa25.16■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.16■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.15■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 PLIN1O60240 522 aa25.15■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.15■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 IL16Q14005 1332 aa25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 H0YGN5 161 aa25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 TLR2O60603 784 aa25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 UBE4AQ14139 1066 aa25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.14■■□□□ 1.62
RABGGTA-214ENST00000560163 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.14■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 CRKP46108 304 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 GYG1P46976 350 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 F6X3S4 739 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 VAMP4O75379 141 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 GRIK5Q16478 980 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 CSADQ9Y600 493 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 TNNI2P48788 182 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 BTBD19C9JJ37 291 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 GNRH1P01148 92 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 CETPP11597 493 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 ERO1BQ86YB8 467 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 GRM8O00222 908 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 IRF6O14896 467 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-214ENST00000560163 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.08■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 PRMT2P55345 433 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF22Q14807 665 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 SHISA4Q96DD7 197 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 CTGFP29279 349 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 CACNB3P54284 484 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC184Q52MB2 194 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 C17orf99Q6UX52 265 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 MRIQ9BWK5 157 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 PPIL2Q13356 520 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 SNAPC2Q13487 334 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 MTFR1Q15390 333 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 KAZALD1Q96I82 304 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 WRNIP1Q96S55 665 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM83AQ86UY5 434 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 TEKT1Q969V4 418 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 TRIM47Q96LD4 638 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 SRRDQ9UH36 339 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-214ENST00000560163 PPATQ06203 517 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 PRO3102Q9H379 93 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 COL6A3P12111 3177 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 ALDH1L1O75891 902 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 HOOK2Q96ED9 719 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 PSMC4P43686 418 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 SUCLG2Q96I99 432 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 CPA4Q9UI42 421 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 A0A0C4DFX4 3053 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 OSBPP22059 807 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 GJA8P48165 433 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 MOGSQ13724 837 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 VPS37DQ86XT2 251 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-214ENST00000560163 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
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