RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 CFAP100Q494V2 611 aa23.11■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 TEKT1Q969V4 418 aa23.11■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 BCL11AQ9H165 835 aa23.11■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 MYO1BO43795 1136 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 SPDYE6P0CI01 402 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 PRDX5P30044 214 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 PI16Q6UXB8 463 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 PASKQ96RG2 1323 aa23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 HSPA6P17066 643 aa23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 CRKP46108 304 aa23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 SULF1Q8IWU6 871 aa23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 ABCF2Q9UG63 623 aa23.09■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 AK9Q5TCS8 1911 aa23.08■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 GCC1Q96CN9 775 aa23.08■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.08■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 MRIQ9BWK5 157 aa23.07■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 APLP1P51693 650 aa23.06■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.06■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.06■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.06■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 SNRKQ9NRH2 765 aa23.06■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.06■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 FOCADQ5VW36 1801 aa23.05■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 TRAF5O00463 557 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 USP48Q86UV5 1035 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 SLF2Q8IX21 1173 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 GPATCH3Q96I76 525 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 ADM5C9JUS6 153 aa23.03■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 ZAP70P43403 619 aa23.03■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.03■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.03■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.03■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 CLRN2A0PK11 232 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 RAI14Q9P0K7 980 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-208ENST00000558954 IGSF3O75054 1194 aa23.01■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 GSTO1P78417 241 aa23.01■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 MECOMQ03112 1051 aa23.01■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 TNFAIP1Q13829 316 aa23.01■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 SMC5Q8IY18 1101 aa23.01■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 VEZTQ9HBM0 779 aa23.01■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 AOX1Q06278 1338 aa23.01■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP5JP18859 108 aa23■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 CREBZFQ9NS37 354 aa23■■□□□ 1.27
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RABGGTA-208ENST00000558954 TMOD2Q9NZR1 351 aa23■■□□□ 1.27
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RABGGTA-208ENST00000558954 GAKO14976 1311 aa23■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.99■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 IGHDP01880 384 aa22.99■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
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RABGGTA-208ENST00000558954 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.99■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.99■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.99■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.99■■□□□ 1.27
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RABGGTA-208ENST00000558954 CDCA5Q96FF9 252 aa22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.97■■□□□ 1.27
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RABGGTA-208ENST00000558954 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 TNNI2P48788 182 aa22.96■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF384Q8TF68 577 aa22.96■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 HAUS7Q99871 368 aa22.96■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.96■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.96■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.96■■□□□ 1.27
RABGGTA-208ENST00000558954 GOLIM4O00461 696 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 NEFLP07196 543 aa22.95■■□□□ 1.26
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