RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXW7Q969H0 707 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.64■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.64■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF2CQ99661 725 aa20.64■□□□□ 0.9
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPAA1O43292 621 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGSF3O75054 1194 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP7A1P22680 504 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 NIM1KQ8IY84 436 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 JDP2Q8WYK2 163 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 AIDAQ96BJ3 306 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 PALD1Q9ULE6 856 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRDX5P30044 214 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 RASSF7Q02833 373 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 VPS53Q5VIR6 699 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANAPC15P60006 121 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L3A6NCW0 530 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L4A6NCW7 530 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 MECOMQ03112 1051 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 NECTIN1Q15223 517 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF20Q5VTR2 975 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.61■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 RABEP1Q15276 862 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.6■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 YDJCA8MPS7 323 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 MBD4O95243 580 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 BECN1Q14457 450 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCN9AQ15858 1988 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC27A2O14975 620 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 APPP05067 770 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARMT1Q9H993 441 aa20.59■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL4A5P29400 1685 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 GSTO1P78417 241 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR162Q16538 588 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 RASEFQ8IZ41 740 aa20.58■□□□□ 0.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.58■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 LMNB1P20700 586 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 DACT2Q5SW24 774 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRIK5Q16478 980 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLF2Q8IX21 1173 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCORLQ8N3X6 602 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF384Q8TF68 577 aa20.57■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSME4Q14997 1843 aa20.56■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAD17O75943 681 aa20.56■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 LDHCP07864 332 aa20.56■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 CERS5Q8N5B7 392 aa20.56■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.56■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC4A3P48751 1232 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSCBQ8IWL3 235 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 MXD3Q9BW11 206 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.55■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 ST18O60284 1047 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNAT2P19087 354 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRELPP51888 382 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEK4P51957 841 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNB2Q92953 911 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSMD14O00487 310 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRIN3BO60391 1043 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 FGAP02671 866 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNIP1Q15025 636 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 F8W031 263 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 FOXP2O15409 715 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP21A2P08686 494 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms