RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558593.1

GABPB1-AS1-203, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GABPB1-AS1, Length 507 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLC39A6Q13433 755 aa8.76□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.76□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.76□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ALG2Q9H553 416 aa8.76□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 H0YIN7 160 aa8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DGAT1O75907 488 aa8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GORABQ5T7V8 394 aa8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GLMNQ92990 594 aa8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TESK2Q96S53 571 aa8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.75□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 COL15A1P39059 1388 aa8.74□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TONSLQ96HA7 1378 aa8.74□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ESPNB1AK53 854 aa8.74□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TM4SF1P30408 202 aa8.74□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MTHFSP49914 203 aa8.74□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CYP4F22Q6NT55 531 aa8.74□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 OLFM4Q6UX06 510 aa8.74□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa8.74□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLX4Q8IY92 1834 aa8.74□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.74□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.74□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FAM177BA6PVY3 158 aa8.73□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 AOC2O75106 756 aa8.73□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SOX10P56693 466 aa8.73□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DEFB115Q30KQ5 88 aa8.73□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C1orf141Q5JVX7 400 aa8.73□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RNF135Q8IUD6 432 aa8.73□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HPS1Q92902 700 aa8.73□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DRC1Q96MC2 740 aa8.73□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.73□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PCNTO95613 3336 aa8.73□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NR3C2P08235 984 aa8.72□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.72□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LDHDQ86WU2 507 aa8.72□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.72□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.72□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PASKQ96RG2 1323 aa8.72□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NRXN2Q9P2S2 1712 aa8.71□□□□□ -1.01
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.71□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.71□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TRAF5O00463 557 aa8.71□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.71□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.71□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.71□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.71□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.71□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NCAPD2Q15021 1401 aa8.71□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EPHX2P34913 555 aa8.7□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DGKZQ13574 1117 aa8.7□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLC51AQ86UW1 340 aa8.7□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CNTROBQ8N137 903 aa8.7□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CAPNS2Q96L46 248 aa8.7□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.7□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 POLKQ9UBT6 870 aa8.7□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NARFQ9UHQ1 456 aa8.7□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.7□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.7□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.69□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ANKRD62A6NC57 917 aa8.69□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 Q6ZNB5 142 aa8.69□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.69□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LGR6Q9HBX8 967 aa8.69□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.69□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HACL1Q9UJ83 578 aa8.69□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LTBP1Q14766 1721 aa8.68□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.68□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 AVPP01185 164 aa8.68□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SKIP12755 728 aa8.68□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ERCC3P19447 782 aa8.68□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.68□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.68□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CNPY4Q8N129 248 aa8.68□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.68□□□□□ -1.02
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SCN4AP35499 1836 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms