RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
TTC7B-202ENST00000553948 BCAR3O75815 825 aa40.25■■■■■ 4.03
TTC7B-202ENST00000553948 TNFAIP1Q13829 316 aa40.25■■■■■ 4.03
TTC7B-202ENST00000553948 RASA3Q14644 834 aa40.25■■■■■ 4.03
TTC7B-202ENST00000553948 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
TTC7B-202ENST00000553948 FZD1Q9UP38 647 aa40.25■■■■■ 4.03
TTC7B-202ENST00000553948 SSC5DA1L4H1 1573 aa40.24■■■■■ 4.03
TTC7B-202ENST00000553948 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
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TTC7B-202ENST00000553948 ATP2B3Q16720 1220 aa40.22■■■■■ 4.03
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TTC7B-202ENST00000553948 COPRSQ9NQ92 184 aa40.21■■■■■ 4.03
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TTC7B-202ENST00000553948 MRIQ9BWK5 157 aa40.17■■■■■ 4.02
TTC7B-202ENST00000553948 TNNQ9UQP3 1299 aa40.17■■■■■ 4.02
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TTC7B-202ENST00000553948 MCOLN1Q9GZU1 580 aa40.16■■■■■ 4.02
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TTC7B-202ENST00000553948 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
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TTC7B-202ENST00000553948 USP2O75604 605 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
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TTC7B-202ENST00000553948 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa40.11■■■■■ 4.01
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TTC7B-202ENST00000553948 TMEM39BQ9GZU3 492 aa40.11■■■■■ 4.01
TTC7B-202ENST00000553948 HHIPL2Q6UWX4 724 aa40.1■■■■■ 4.01
TTC7B-202ENST00000553948 TMOD2Q9NZR1 351 aa40.1■■■■■ 4.01
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TTC7B-202ENST00000553948 ELP3Q9H9T3 547 aa39.99■■■■□ 3.99
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TTC7B-202ENST00000553948 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa39.98■■■■□ 3.99
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TTC7B-202ENST00000553948 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
TTC7B-202ENST00000553948 OPTNQ96CV9 577 aa39.96■■■■□ 3.99
TTC7B-202ENST00000553948 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP39.95■■■■□ 3.99
TTC7B-202ENST00000553948 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP39.95■■■■□ 3.99
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